RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF665Q9H7R5 613 aa12.59□□□□□ -0.39
CSAG1-202ENST00000370287 LPAR2Q9HBW0 351 aa12.59□□□□□ -0.39
CSAG1-202ENST00000370287 ADGRL4Q9HBW9 690 aa12.59□□□□□ -0.39
CSAG1-202ENST00000370287 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
CSAG1-202ENST00000370287 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa12.59□□□□□ -0.39
CSAG1-202ENST00000370287 NPTNQ9Y639 398 aa12.59□□□□□ -0.39
CSAG1-202ENST00000370287 SLC22A31A6NKX4 558 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 APOL3O95236 402 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 IGHV2-70P01814 119 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 IGHV2-5P01817 119 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 APOC1P02654 83 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 PMELP40967 661 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 SRP9P49458 86 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 TIGD6Q17RP2 521 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 KRT77Q7Z794 578 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 MOGAT3Q86VF5 341 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 GID4Q8IVV7 300 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 SLC35F2Q8IXU6 374 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 OR8B12Q8NGG6 310 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 FAM81AQ8TBF8 368 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 UBE2FQ969M7 185 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 LYZL4Q96KX0 146 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 OR8B4Q96RC9 309 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 MBOAT4Q96T53 435 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 SLC29A1Q99808 456 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 GAL3ST1Q99999 423 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 OR10A2Q9H208 303 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM160Q9NX00 188 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 CUBNO60494 3623 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 JMJD1CQ15652 2540 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM178BH3BS89 294 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF205O95201 554 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 SBK2P0C263 348 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 CD200P41217 278 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 RAD23AP54725 363 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 CXCR4P61073 352 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 OR8G1Q15617 311 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 SSX6Q7RTT6 188 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 C10orf67Q8IYJ2 551 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 OR52H1Q8NGJ2 320 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 OR51G2Q8NGK0 314 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 OR8J1Q8NGP2 316 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 EME1Q96AY2 570 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 HRASLS5Q96KN8 279 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 C9orf16Q9BUW7 83 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 SP140LQ9H930 580 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 FAM206AQ9NX38 181 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 HAO2Q9NYQ3 351 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 UBAP1Q9NZ09 502 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 B4DSR2 109 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 ANKRD65E5RJM6 399 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 HTR1FP30939 366 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 GATA4P43694 442 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 GSK3AP49840 483 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 CDC42P60953 191 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 BTG1P62324 171 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 ROM1Q03395 351 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 ZMYND11Q15326 602 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 MPPED2Q15777 294 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 CR1LQ2VPA4 569 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 CHRFAM7AQ494W8 412 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 FAM201AQ5SY85 155 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 FAM120AOSQ5T036 256 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF679Q8IYX0 411 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 TBX5Q99593 518 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 SLC22A4Q9H015 551 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 NIPAL2Q9H841 368 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 UFSP2Q9NUQ7 469 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 CLN6Q9NWW5 311 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 IKZF2Q9UKS7 526 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 ORC6Q9Y5N6 252 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 FAM20BO75063 409 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 BAG2O95816 211 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 MSMBP08118 114 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 ACKR3P25106 362 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 OR8B8Q15620 311 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 DEGS2Q6QHC5 323 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 ASB17Q8WXJ9 295 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 PPP1R14AQ96A00 147 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM186Q96B77 213 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 RAB39BQ96DA2 213 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-202ENST00000370287 APOL4Q9BPW4 351 aa12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms