RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558258.1

AC009558.2-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC009558.2, Length 396 nt, Biotype sense intronic.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009558.2-201ENST00000558258 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 RNLSQ5VYX0 342 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 METTL21CQ5VZV1 264 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 SLC25A25Q6KCM7 469 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 RHBDD2Q6NTF9 364 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 B3GLCTQ6Y288 498 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 Q6ZRG5 221 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 PAQR7Q86WK9 346 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 C17orf64Q86WR6 236 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 MREGQ8N565 214 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 OR5T1Q8NG75 326 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 OR4E2Q8NGC2 313 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 OR1K1Q8NGR3 316 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 RHEBL1Q8TAI7 183 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 DCAKDQ8WVC6 231 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 CACNG8Q8WXS5 425 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 NTNG2Q96CW9 530 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 WDR34Q96EX3 536 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 OR4K3Q96R72 315 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 PCBD2Q9H0N5 130 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 NT5DC2Q9H857 520 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 FOLH1BQ9HBA9 442 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 FAM60AQ9NP50 221 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 DIABLOQ9NR28 239 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 CLEC2DQ9UHP7 191 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 RPH3ALQ9UNE2 315 aa3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 FASNP49327 2511 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
AC009558.2-201ENST00000558258 PTPN13Q12923 2485 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 AIM2O14862 343 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 KIAA0513O60268 411 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 PIAS1O75925 651 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 DHFRP00374 187 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 KRT6AP02538 564 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 STSP08842 583 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 HBQ1P09105 142 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 OR4E1P0C645 316 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 CPA3P15088 417 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 PRPS1L1P21108 318 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 CDKN2CP42773 168 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 BCAP31P51572 246 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 REEP5Q00765 189 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 PDE7AQ13946 482 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 DGCR6Q14129 220 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 TGFBIQ15582 683 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 TSNQ15631 228 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 CCDC58Q4VC31 144 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 VWA2Q5GFL6 755 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 LIPNQ5VXI9 398 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 OR5M10Q6IEU7 315 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 PRMT9Q6P2P2 845 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 AGTRAPQ6RW13 159 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 TIFABQ6ZNK6 161 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 COX15Q7KZN9 410 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 VN1R4Q7Z5H5 301 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 CMC1Q7Z7K0 106 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 CYP4Z1Q86W10 505 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 PLCZ1Q86YW0 608 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 IFT20Q8IY31 132 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 ZNF786Q8N393 782 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 COMMD1Q8N668 190 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 TMEM185AQ8NFB2 350 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 OR4F5Q8NH21 305 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 OR52N1Q8NH53 320 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 MCOLN3Q8TDD5 553 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 HAS2Q92819 552 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 ESAMQ96AP7 390 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 SLC25A36Q96CQ1 311 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 C16orf58Q96GQ5 468 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 OR2A5Q96R48 311 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 TMEM246Q9BRR3 403 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 ZNF416Q9BWM5 594 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 NLNQ9BYT8 704 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 ULBP3Q9BZM4 244 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 ATG10Q9H0Y0 220 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 OR51B5Q9H339 312 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 RGCCQ9H4X1 137 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 CAB39LQ9H9S4 337 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 LHX9Q9NQ69 397 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 MS4A12Q9NXJ0 267 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 TAC3Q9UHF0 121 aa3.52□□□□□ -1.85
AC009558.2-201ENST00000558258 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms