RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	MMP27	Q9H306	513 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SIAE	Q9HAT2	523 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	POLE4	Q9NR33	117 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	IL20	Q9NYY1	176 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	AASS	Q9UDR5	926 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	B9D1	Q9UPM9	204 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688		H0YHG0	523 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	IFNL4	K9M1U5	179 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ARPC3	O15145	178 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SURF4	O15260	269 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	PRKY	O43930	277 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	APOL3	O95236	402 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	TXNDC12	O95881	172 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	KNG1	P01042	644 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SPARC	P09486	303 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ZNF3	P17036	446 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	GRK5	P34947	590 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	PCBD1	P61457	104 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	PPP1CB	P62140	327 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	BTG1	P62324	171 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	GLO1	Q04760	184 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SNAPC1	Q16533	368 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ESCO2	Q56NI9	601 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	C10orf128	Q5T292	105 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	FAM27B	Q5VT28	67 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ZNF774	Q6NX45	483 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ADCK1	Q86TW2	530 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	PARP8	Q8N3A8	854 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	LNX2	Q8N448	690 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ZNF511	Q8NB15	262 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SLC7A6	Q92536	515 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	UPRT	Q96BW1	309 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	NRBF2	Q96F24	287 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	CITED4	Q96RK1	184 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	MBOAT4	Q96T53	435 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	WDR76	Q9H967	626 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	C5orf49	A4QMS7	147 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	RER1	O15258	196 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	DOK2	O60496	412 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SELENOF	O60613	162 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	FSTL3	O95633	263 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	CLIC3	O95833	236 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	PLAT	P00750	562 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	NGF	P01138	241 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	IFNG	P01579	166 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ALPL	P05186	524 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SPI1	P17947	270 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	MSR1	P21757	451 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	CD80	P33681	288 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	MPV17	P39210	176 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	WNT5A	P41221	380 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ALDH3A2	P51648	485 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	HCCS	P53701	268 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	CDK5	Q00535	292 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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