RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 AMBNQ9NP70 447 aa15.88■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 PSMD9O00233 223 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 F12P00748 615 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 OR2T7P0C7T2 308 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 DBTP11182 482 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 RGS6P49758 472 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 RPS23P62266 143 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 GRB2P62993 217 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 ZNF85Q03923 595 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 ZNF91Q05481 1191 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 POU4F2Q12837 409 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 CDK5R2Q13319 367 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 SNAI3Q3KNW1 292 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 ALKBH6Q3KRA9 238 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 ZNF684Q5T5D7 378 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 ARL9Q6T311 187 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 DRAM2Q6UX65 266 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 C1orf174Q8IYL3 243 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 OR2T27Q8NH04 317 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 SYNPRQ8TBG9 265 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 SPTSSAQ969W0 71 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 LGALS12Q96DT0 336 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 Q96MT0 163 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 OR8B4Q96RC9 309 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 MNTQ99583 582 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 TTTY10Q9BZA0 68 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 TMEM160Q9NX00 188 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 ZNF319Q9P2F9 582 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 LPAR3Q9UBY5 353 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 DUSP13Q9UII6 198 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 VSTM5A8MXK1 200 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 VWC2LB2RUY7 222 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 LMX1BO60663 402 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 IGHV3-13P01766 116 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 LCATP04180 440 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 ADRA2AP08913 450 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 H2BFMP0C1H6 154 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 SLC2A1P11166 492 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 NR4A2P43354 598 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 SLC15A1P46059 708 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 CXCR4P61073 352 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 PSG7Q13046 419 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 TAF13Q15543 124 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 ZNF718Q3SXZ3 478 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 FAM166AQ6J272 317 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 DEGS2Q6QHC5 323 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 TBX5Q99593 518 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 ZNF649Q9BS31 505 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 KCNS2Q9ULS6 477 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 LRP12Q9Y561 859 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 J3QW42 95 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 SRD5A1P18405 259 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 TUBG1P23258 451 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 CX3CR1P49238 355 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 GZMKP49863 264 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 IZUMO2Q6UXV1 221 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 FBXW12Q6X9E4 464 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 SETD9Q8NE22 299 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 ASB17Q8WXJ9 295 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 HAVCR1Q96D42 359 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 BPESC1Q9GZL8 116 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 TUBG2Q9NRH3 451 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 PTTG3PQ9NZH4 202 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 MYRFQ9Y2G1 1151 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 H3BSA7 217 aa15.84■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 ALDH3B1P43353 468 aa15.84■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 FAM120AOSQ5T036 256 aa15.84■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 KRT77Q7Z794 578 aa15.84■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 ZNF679Q8IYX0 411 aa15.84■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 ZNF283Q8N7M2 679 aa15.84■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 OR10H4Q8NGA5 316 aa15.84■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 CMBLQ96DG6 245 aa15.84■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 VCX3BQ9H321 246 aa15.84■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 TAAR3PQ9P1P4 343 aa15.84■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PUF60-218ENST00000531995 NDUFS8O00217 210 aa15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms