RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	EBF4	Q9BQW3	602 aa		2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	LXN	Q9BS40	222 aa		2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	DERL2	Q9GZP9	239 aa		2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	MED28	Q9H204	178 aa		2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	OPTC	Q9UBM4	332 aa		2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	GNG8	Q9UK08	70 aa		2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF222	Q9UK12	451 aa		2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		2.78	□□□□□ -1.96
COPS5-208	ENST00000519057	MCM3AP	O60318	1980 aa		2.78	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057		A0A1B0GVI7	797 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	XKRY2	A2RUG3	117 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	C5orf51	A6NDU8	294 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	FAM74A7	A6NL05	159 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	CLDN24	A6NM45	220 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	DFFA	O00273	331 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	ARPC5	O15511	151 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	AIRE	O43918	545 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF861P	O60384	105 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	CTNS	O60931	367 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	DNAJB6	O75190	326 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	RP2	O75695	350 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	ANXA9	O76027	345 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	F10	P00742	488 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	SERPINA3	P01011	423 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	IGHV3-9	P01782	118 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	RLN1	P04808	185 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	GUSB	P08236	651 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	CPN1	P15169	458 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	NT5E	P21589	574 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	STOM	P27105	288 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	HSD11B1	P28845	292 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	OR1E1	P30953	314 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	S100A11	P31949	105 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	CDKN1B	P46527	198 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	KCNJ3	P48549	501 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	PITPNB	P48739	271 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	MFAP2	P55001	183 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	SLC12A3	P55017	1021 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	PRPS1	P60891	318 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	SP4	Q02446	784 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	TLE4	Q04727	773 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	BST1	Q10588	318 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	VGLL4	Q14135	290 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	GPR176	Q14439	515 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	PIGG	Q5H8A4	983 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	XAF1	Q6GPH4	301 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	SPESP1	Q6UW49	350 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	STRADA	Q7RTN6	431 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	SSX6	Q7RTT6	188 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	LAX1	Q8IWV1	398 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	ZFP82	Q8N141	532 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	UBA3	Q8TBC4	463 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
COPS5-208	ENST00000519057	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		2.77	□□□□□ -1.97

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