RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 GSTM3P21266 225 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 LIPAP38571 399 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 MAGEA2P43356 314 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC6A9P48067 706 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 PRKXP51817 358 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 MAB21L1Q13394 359 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 CRMP1Q14194 572 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
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PRPF4B-208ENST00000490653 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.13□□□□□ -1.43
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PRPF4B-208ENST00000490653 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 TIMD4Q96H15 378 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 DIRC2Q96SL1 478 aa6.13□□□□□ -1.43
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PRPF4B-208ENST00000490653 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 HCAR1Q9BXC0 346 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 NDEL1Q9GZM8 345 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 ESM1Q9NQ30 184 aa6.13□□□□□ -1.43
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PRPF4B-208ENST00000490653 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 TGP01266 2768 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM183AA6NL82 134 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 IQCF6A8MYZ5 107 aa6.12□□□□□ -1.43
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PRPF4B-208ENST00000490653 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 ACOT8O14734 319 aa6.12□□□□□ -1.43
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PRPF4B-208ENST00000490653 ANPEPP15144 967 aa6.12□□□□□ -1.43
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PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF92Q03936 586 aa6.12□□□□□ -1.43
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PRPF4B-208ENST00000490653 LCN8Q6JVE9 175 aa6.12□□□□□ -1.43
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PRPF4B-208ENST00000490653 C1orf174Q8IYL3 243 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 ZDHHC22Q8N966 263 aa6.12□□□□□ -1.43
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PRPF4B-208ENST00000490653 DEFB108BQ8NET1 73 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.12□□□□□ -1.43
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PRPF4B-208ENST00000490653 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
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PRPF4B-208ENST00000490653 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 CENPMQ9NSP4 180 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM100Q9NV29 134 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF69Q9UC07 566 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM20BO75063 409 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 FCN3O75636 299 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM107AO95990 144 aa6.11□□□□□ -1.43
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