RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MPLP40238 635 aa13.8□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CSRP2Q16527 193 aa13.8□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM225Q6GV28 225 aa13.8□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR4S1Q8NGB4 309 aa13.8□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SFT2D1Q8WV19 159 aa13.8□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LIPHQ8WWY8 451 aa13.8□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MCHR2Q969V1 340 aa13.8□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CMBLQ96DG6 245 aa13.8□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARL6Q9H0F7 186 aa13.8□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CKLFQ9UBR5 152 aa13.8□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTFP1Q9UDX5 166 aa13.8□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MIOXQ9UGB7 285 aa13.8□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXO4Q9UKT5 387 aa13.8□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LY86O95711 162 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAUP35544 74 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MC2RQ01718 297 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MOGAT2Q3SYC2 334 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF626Q68DY1 528 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD16Q6P6B7 361 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD163Q86VB7 1156 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SGK3Q96BR1 496 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CMTM3Q96MX0 182 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPACA5Q96QH8 159 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TXNIPQ9H3M7 391 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WIF1Q9Y5W5 379 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ST8SIA5O15466 376 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD2P06729 351 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPP1P10451 314 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AKR1C2P52895 323 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRSS12P56730 875 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AKR1C1Q04828 323 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GFOD2Q3B7J2 385 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELFN2Q5R3F8 820 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OLFML2AQ68BL7 652 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF248Q8NDW4 579 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR4K17Q8NGC6 315 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF519Q8TB69 540 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASB5Q8WWX0 329 aa13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM235A6NFC5 223 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKUB1A6NFN9 424 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DXOO77932 396 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FGF2P09038 288 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PNLIPP16233 465 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCN2P20062 427 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLO1Q04760 184 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LIN54Q6MZP7 749 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHST4Q8NCG5 386 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXO17Q96EF6 278 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATMQ13315 3056 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CER1O95813 267 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AMY2AP04746 511 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HTR2CP28335 458 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EIF1P41567 113 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SORDQ00796 357 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELP2Q6IA86 826 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STEAP1BQ6NZ63 245 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COMMD2Q86X83 199 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GALNT16Q8N428 558 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM156Q8N614 296 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STK35Q8TDR2 534 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SOX7Q9BT81 388 aa13.78□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa13.77□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa13.77□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa13.77□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR31O00270 319 aa13.77□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF432O94892 652 aa13.77□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 S100A9P06702 114 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSF1Q00613 529 aa13.77□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLPPR5Q32ZL2 321 aa13.77□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C9orf152Q5JTZ5 239 aa13.77□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUP54Q7Z3B4 507 aa13.77□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUBPLQ8TB37 319 aa13.77□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF128Q8TEB7 428 aa13.77□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM234Q8WY98 164 aa13.77□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POFUT1Q9H488 388 aa13.77□□□□□ -0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa13.77□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCSO14618 274 aa13.77□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STK17BO94768 372 aa13.77□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AKAIN1P0CW23 69 aa13.77□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COX6A1P12074 109 aa13.77□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UCN2Q96RP3 112 aa13.77□□□□□ -0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms