RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476784.5

TTC3-215, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTC3, Length 7,425 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-215ENST00000476784 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.442e-6■■■□□ 14.6
TTC3-215ENST00000476784 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 RHOFQ9HBH0 211 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 SSSCA1O60232 199 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 SNNO75324 88 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
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TTC3-215ENST00000476784 PDLIM4P50479 330 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 GABARAPL2P60520 117 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 PPP1CBP62140 327 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 THEM4Q5T1C6 240 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 FITM2Q8N6M3 262 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 NECAP1Q8NC96 275 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 TTC9Q92623 222 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 ERGIC1Q969X5 290 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 BTF3L4Q96K17 158 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 ACPTQ9BZG2 426 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 HSD3B7Q9H2F3 369 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 PRELID1Q9Y255 219 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 H0YIG0 161 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 FZD6O60353 706 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 CBR1P16152 277 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 DUSP1P28562 367 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 MAGEA5P43359 124 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 OLIG3Q7RTU3 272 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 PIGMQ9H3S5 423 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 MOKQ9UQ07 419 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 FCGR3BO75015 233 aa6.05□□□□□ -1.44
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TTC3-215ENST00000476784 CNR1P21554 472 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 NME2P22392 152 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 ATP4BP51164 291 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 SPINK9Q5DT21 86 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.05□□□□□ -1.44
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TTC3-215ENST00000476784 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 PELI1Q96FA3 418 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
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TTC3-215ENST00000476784 RAB18Q9NP72 206 aa6.05□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.05□□□□□ -1.44
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TTC3-215ENST00000476784 CSNK1G2P78368 415 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 FOXO1Q12778 655 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 PDCD1Q15116 288 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 PFN4Q8NHR9 129 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 TMEM106AQ96A25 262 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 PRR14Q9BWN1 585 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 MT-ATP6P00846 226 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 OR2F1Q13607 317 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 D2HGDHQ8N465 521 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 FOXB1Q99853 325 aa6.04□□□□□ -1.44
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TTC3-215ENST00000476784 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.04□□□□□ -1.44
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TTC3-215ENST00000476784 RAXQ9Y2V3 346 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 ABCC6O95255 1503 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 M0QYG6 137 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 P2RX6O15547 441 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 PSMB2P49721 201 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 REEP5Q00765 189 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 C1orf185Q5T7R7 199 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 SLC7A13Q8TCU3 470 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 OPALINQ96PE5 141 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.04□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.04□□□□□ -1.44
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