RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 OPRL1P41146 370 aa17.86■□□□□ 0.45
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SH3BP4-204ENST00000416021 GLYATL3Q5SZD4 288 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM166AQ6J272 317 aa17.86■□□□□ 0.45
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SH3BP4-204ENST00000416021 SLC16A9Q7RTY1 509 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
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SH3BP4-204ENST00000416021 TIMD4Q96H15 378 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 C1orf159Q96HA4 380 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 OR2V2Q96R30 315 aa17.86■□□□□ 0.45
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SH3BP4-204ENST00000416021 OR10AD1Q8NGE0 317 aa17.85■□□□□ 0.45
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SH3BP4-204ENST00000416021 YIPF3Q9GZM5 350 aa17.85■□□□□ 0.45
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SH3BP4-204ENST00000416021 LAMP5Q9UJQ1 280 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1B0GWJ7 208 aa17.84■□□□□ 0.45
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SH3BP4-204ENST00000416021 TBX1O43435 398 aa17.84■□□□□ 0.45
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SH3BP4-204ENST00000416021 LCN1P1Q5VSP4 162 aa17.84■□□□□ 0.45
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SH3BP4-204ENST00000416021 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 SGK3Q96BR1 496 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 MEGF10Q96KG7 1140 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 GABARAPL3Q9BY60 117 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 S100A14Q9HCY8 104 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM106BQ9NUM4 274 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM160Q9NX00 188 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa17.84■□□□□ 0.45
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SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa17.84■□□□□ 0.45
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SH3BP4-204ENST00000416021 F5H5P2 479 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 XRCC2O43543 280 aa17.83■□□□□ 0.44
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SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
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SH3BP4-204ENST00000416021 PRSS45Q7RTY3 260 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 GCM1Q9NP62 436 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 BRD7Q9NPI1 651 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 DCAF16Q9NXF7 216 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 B4DSR2 109 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRN1Q6UXK5 716 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 OR52H1Q8NGJ2 320 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 SPSB4Q96A44 273 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC22A4Q9H015 551 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 OPA3Q9H6K4 179 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF319Q9P2F9 582 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 NPTNQ9Y639 398 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM157AC9JC47 383 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 ALPLP05186 524 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 SBK2P0C263 348 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 CA6P23280 308 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 TIGD6Q17RP2 521 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 CHRFAM7AQ494W8 412 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT77Q7Z794 578 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 REEP6Q96HR9 211 aa17.81■□□□□ 0.44
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SH3BP4-204ENST00000416021 BEX2Q9BXY8 128 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 OR10A2Q9H208 303 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF665Q9H7R5 613 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 USE1Q9NZ43 259 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 ORC6Q9Y5N6 252 aa17.81■□□□□ 0.44
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SH3BP4-204ENST00000416021 ISPDA4D126 451 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC22A31A6NKX4 558 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 EI24O14681 340 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 DDOSTP39656 456 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 ALDH3A2P51648 485 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 RAD23AP54725 363 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM3AP98173 230 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 MAB21L1Q13394 359 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 OR8G1Q15617 311 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 CBR4Q8N4T8 237 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
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