RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 MYOTQ9UBF9 498 aa14.54□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa14.54□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 LOC100509620A0A075B734 347 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM82A0PJX8 343 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 RLN2P04090 185 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 OR4E1P0C645 316 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 SLC2A1P11166 492 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ACY1Q03154 408 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 UNC119Q13432 240 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 GVQW1Q8N7I0 195 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 OR1J2Q8NGS2 313 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 PBOV1Q9GZY1 135 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 SYT7O43581 403 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 CYB5AP00167 134 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 SORDQ00796 357 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 DEGS2Q6QHC5 323 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 TMUB2Q71RG4 321 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 CYYR1Q96J86 154 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 SPSB2Q99619 263 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 CRB3Q9BUF7 120 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 BIN3Q9NQY0 253 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 U3KQA8 63 aa14.53□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 RAB27BO00194 218 aa14.52□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 SULT1C2O00338 296 aa14.52□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 BDKRB2P30411 391 aa14.52□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 S100A11P31949 105 aa14.52□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 SFTPDP35247 375 aa14.52□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 CXCL12P48061 93 aa14.52□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 BPIFB2Q8N4F0 458 aa14.52□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.52□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 OR5B2Q96R09 309 aa14.52□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 POTEKPQ9BYX7 375 aa14.52□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ARL6Q9H0F7 186 aa14.52□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 RARRES3Q9UL19 164 aa14.52□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.52□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 LHFPL6Q9Y693 200 aa14.52□□□□□ -0.08
SHQ1-201ENST00000325599 CBR1P16152 277 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 LAP3P28838 519 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PRKXP51817 358 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 FGL1Q08830 312 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 DMRTC1Q5HYR2 192 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 OR52W1Q6IF63 320 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 KLHL24Q6TFL4 600 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CHST4Q8NCG5 386 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 OR5T2Q8NGG2 359 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 OR13C8Q8NGS7 320 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 RNF138Q8WVD3 245 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 C1orf198Q9H425 327 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 KLHL13Q9P2N7 655 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 WIF1Q9Y5W5 379 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 NPIPB13A6NJU9 1138 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 NPIPB4C9JG80 1138 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 EIF1P41567 113 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CLRN1P58418 232 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 FJX1Q86VR8 437 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 MRGPRX4Q96LA9 322 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC74BQ96LY2 380 aa14.52□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PTAFRP25105 342 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 P2RY4P51582 365 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CLDN6P56747 220 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PRAMEF20Q5VT98 475 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 UEVLDQ8IX04 471 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 NKAIN3Q8N8D7 197 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 OR1M1Q8NGA1 313 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 OR5L2Q8NGL0 311 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 OCIAD1Q9NX40 245 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 WNT16Q9UBV4 365 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ZFAND5O76080 213 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SNAPINO95295 136 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CELA2AP08217 269 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 FGF2P09038 288 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 VSIG8P0DPA2 414 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ABOP16442 354 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF260Q3ZCT1 412 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SFT2D1Q8WV19 159 aa14.51□□□□□ -0.09
SHQ1-201ENST00000325599 AQP3Q92482 292 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms