RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603232.6

CELF4-223, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CELF4, Length 1,906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-223	ENST00000603232	C11orf98	E9PRG8	122 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	PLPP3	O14495	311 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	ABCD4	O14678	606 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	SPARC	P09486	303 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	CTLA4	P16410	223 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	ADAM8	P78325	824 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	CTAG1A	P78358	180 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	MEF2D	Q14814	521 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	RAB12	Q6IQ22	244 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	LCN10	Q6JVE6	187 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	C11orf88	Q6PI97	169 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	NUDT9	Q9BW91	350 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	OR6C76	A6NM76	312 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	TEX46	H3BTG2	121 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	CYB5A	P00167	134 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	RLN2	P04090	185 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	OR1D4	P47884	311 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	FOXL2	P58012	376 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	SORD	Q00796	357 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	ZP4	Q12836	540 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	MARCH3	Q86UD3	253 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	RASL12	Q9NYN1	266 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232		A6NIZ1	184 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	STK17B	O94768	372 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	OR2F2	O95006	317 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	FBXO45	P0C2W1	286 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	RAP1B	P61224	184 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	RAP1A	P62834	184 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	PMPCA	Q10713	525 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	OR2F1	Q13607	317 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	MOB3C	Q70IA8	216 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	PXT1	Q8NFP0	134 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	GPR119	Q8TDV5	335 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	AQP3	Q92482	292 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	NPAS1	Q99742	590 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	DDA1	Q9BW61	102 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	KCNK15	Q9H427	330 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	FADS1	O60427	444 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	AMY2A	P04746	511 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	SLC26A5	P58743	744 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	ZNF546	Q86UE3	836 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	GALNT16	Q8N428	558 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	OR8S1	Q8NH09	359 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	ST8SIA2	Q92186	375 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	TSLP	Q969D9	159 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	PRRT1	Q99946	306 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-223	ENST00000603232	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		13.71	□□□□□ -0.22
CELF4-223	ENST00000603232		A0A1B0GX78	115 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-223	ENST00000603232	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-223	ENST00000603232	DISC1	C4P0D8	188 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-223	ENST00000603232	SCGN	O76038	276 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-223	ENST00000603232	AHSA1	O95433	338 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-223	ENST00000603232	IL2RA	P01589	272 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-223	ENST00000603232	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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