RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506063.1

TCOF1-208, Transcript of treacle ribosome biogenesis factor 1, human

TSL 4

Gene TCOF1, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCOF1-208	ENST00000506063	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		2.58	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		2.58	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	WDR45	Q9Y484	360 aa		2.58	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		2.58	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		2.58	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		2.58	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	NACA	E9PAV3	2078 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063		A0A0G2JND7	137 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	C5orf49	A4QMS7	147 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	PSMB11	A5LHX3	300 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	CCDC154	A6NI56	674 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	C12orf77	C9JDV5	145 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063		F5H5P2	479 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063		J3QL48	77 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063		M0R1W7	72 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	LGALS8	O00214	317 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	CCRL2	O00421	344 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	SURF4	O15260	269 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	GYPA	P02724	150 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	IGF1	P05019	195 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	BCHE	P06276	602 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	TFPT	P0C1Z6	253 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	NR2F1	P10589	423 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	SELL	P14151	372 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	MATN1	P21941	496 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	PRKAR1B	P31321	381 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ARRB2	P32121	409 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	HTR3A	P46098	478 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	OR3A4P	P47883	348 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	DYNLT3	P51808	116 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	DSTN	P60981	165 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	COPZ1	P61923	177 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	HBA1	P69905	142 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	FUT5	Q11128	374 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	FADD	Q13158	208 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	KIR2DS1	Q14954	304 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	GPR68	Q15743	365 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	CYP51A1	Q16850	503 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063		Q5VSD8	79 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ZNF429	Q86V71	674 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	KRT73	Q86Y46	540 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	OR8U1	Q8NH10	309 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	BBS10	Q8TAM1	723 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	STON2	Q8WXE9	905 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ST8SIA4	Q92187	359 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	TMEM54	Q969K7	222 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	NABP1	Q96AH0	204 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	HAVCR1	Q96D42	359 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	SPDL1	Q96EA4	605 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	OR7D2	Q96RA2	312 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ATF6B	Q99941	703 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	OR51I1	Q9H343	314 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	PNPO	Q9NVS9	261 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	MKLN1	Q9UL63	735 aa		2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063		A0A096LPI6	279 aa		2.56	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		2.56	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		2.56	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		2.56	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	OOEP	A6NGQ2	149 aa		2.56	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	LRRC30	A6NM36	301 aa		2.56	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063		A8MVM7	634 aa		2.56	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	EVPLL	A8MZ36	301 aa		2.56	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063		M0R082	166 aa		2.56	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	SHOX	O15266	292 aa		2.56	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms