RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496030.1

APTX-233, Transcript of aprataxin, human

TSL 3

Gene APTX, Length 633 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APTX-233	ENST00000496030	ZNF91	Q05481	1191 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	AGAP6	Q5VW22	663 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	SSX6	Q7RTT6	188 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	LGALS12	Q96DT0	336 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	RNFT2	Q96EX2	444 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	VCX	Q9H320	206 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	FZR1	Q9UM11	496 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	TRIM64B	A6NI03	449 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030		B9A039	149 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030		M0R135	149 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	IGHV3-13	P01766	116 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	ADRA2A	P08913	450 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	OR2T7	P0C7T2	308 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	SLC15A1	P46059	708 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	EVX1	P49640	407 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	RGS6	P49758	472 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	TPTE	P56180	551 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	IL5RA	Q01344	420 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	ZNF85	Q03923	595 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	POU4F2	Q12837	409 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	CDK5R2	Q13319	367 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	ARL9	Q6T311	187 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	DRAM2	Q6UX65	266 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	OR2T27	Q8NH04	317 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	PIGT	Q969N2	578 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	SPTSSA	Q969W0	71 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	ZNF799	Q96GE5	643 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030		Q96MF0	132 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030		Q96MT0	163 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	OR8B4	Q96RC9	309 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	MNT	Q99583	582 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	CCL19	Q99731	98 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	SYT3	Q9BQG1	590 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	ZNF649	Q9BS31	505 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	COPS4	Q9BT78	406 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030		J3QW42	95 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	PSMD9	O00233	223 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	NDUFS7	O75251	213 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	CRLF1	O75462	422 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	LCAT	P04180	440 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	H2BFM	P0C1H6	154 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	SLC2A1	P11166	492 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	TUBG1	P23258	451 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	CDKN1A	P38936	164 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	VHL	P40337	213 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	CXCR4	P61073	352 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	PSG7	Q13046	419 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	TAF13	Q15543	124 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	SETD9	Q8NE22	299 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	HAVCR1	Q96D42	359 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	TBX5	Q99593	518 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	DUSP13	Q9UII6	198 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	LRP12	Q9Y561	859 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	VSTM5	A8MXK1	200 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-233	ENST00000496030	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		10.16	□□□□□ -0.78

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