RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 TPST2O60704 377 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 GADD45GO95257 159 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PTHP01270 115 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 IGHV1-69P01742 117 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 DBIP07108 87 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SMIM18P0DKX4 95 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 IGLL1P15814 213 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 RPS2P15880 293 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 IL7RP16871 459 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PRKAR1BP31321 381 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 TGFBR2P37173 567 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 MMP16P51512 607 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 HMGA2P52926 109 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 COPZ1P61923 177 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 COX10Q12887 443 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SEC23BQ15437 767 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 MICAQ29983 383 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 NRN1LQ496H8 165 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 CASC10Q5T4H9 136 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 FAM69AQ5T7M9 428 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SLC27A4Q6P1M0 643 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 LRFN4Q6PJG9 635 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 Q6ZR03 302 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 UEVLDQ8IX04 471 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 LYG1Q8N1E2 194 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PIP4P2Q8N4L2 257 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 OR4S1Q8NGB4 309 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 OR9Q2Q8NGE9 314 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 OR6N1Q8NGY5 312 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 GIPC3Q8TF64 312 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 POM121L2Q96KW2 1035 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 DHRS1Q96LJ7 313 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 FEVQ99581 238 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM246Q9BRR3 403 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PCGF1Q9BSM1 259 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 OR2J1Q9GZK6 312 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 DPAGT1Q9H3H5 408 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 RIBC2Q9H4K1 309 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM38BQ9NVV0 291 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 KIF17Q9P2E2 1029 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SCOCQ9UIL1 159 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 VPREB3Q9UKI3 123 aa5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 LOC100509620A0A075B734 347 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 A0A087WUJ7 227 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 LCE6AA0A183 80 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF879B4DU55 563 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 E9PQ18 207 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 H3BSA7 217 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SLC16A6O15403 523 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 OR2T1O43869 369 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 CCNB2O95067 398 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF205O95201 554 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 FSTL3O95633 263 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 H1F0P07305 194 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 TNFRSF1AP19438 455 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 CBLP22681 906 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 EPHA2P29317 976 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 GABRA5P31644 462 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 CSNK1A1P48729 337 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 RAD23AP54725 363 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 HOXC5Q00444 222 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 RFX4Q33E94 735 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF404Q494X3 552 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 FGD3Q5JSP0 725 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF691Q5VV52 312 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 TTC23Q5W5X9 447 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM53Q6P2H8 277 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 DPPA2Q7Z7J5 298 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PEX5LQ8IYB4 626 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 AQP11Q8NBQ7 271 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF555Q8NEP9 628 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PPP1R35Q8TAP8 253 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ITLN1Q8WWA0 313 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PLEKHA8Q96JA3 519 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PRRC1Q96M27 445 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 FUZQ9BT04 418 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 GABARAPL3Q9BY60 117 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SLC19A3Q9BZV2 496 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SIRPDQ9H106 197 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 RNF121Q9H920 327 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 GCM1Q9NP62 436 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 KRT84Q9NSB2 600 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 GLTPQ9NZD2 209 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.7 ms