RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468599.1

CNOT10-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, humanhuman

TSL 5

Gene CNOT10, Length 811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT10-211ENST00000468599 AMBNQ9NP70 447 aa9.66□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 CLN6Q9NWW5 311 aa9.66□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF319Q9P2F9 582 aa9.66□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 LAMP5Q9UJQ1 280 aa9.66□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 VPS13CQ709C8 3753 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 H0YAE9 185 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 H7C417 338 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 LILRA1O75019 489 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 LY6HO94772 140 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 H2BFMP0C1H6 154 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 MTNR1AP48039 350 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 SLC6A9P48067 706 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 PPOXP50336 477 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 TPTEP56180 551 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 CXCR4P61073 352 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 GRB2P62993 217 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 ROM1Q03395 351 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 POU4F2Q12837 409 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 PSG7Q13046 419 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 TMED1Q13445 227 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 GLYATL3Q5SZD4 288 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 MEDAGQ5VYS4 303 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 TTC23Q5W5X9 447 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 DRAM2Q6UX65 266 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 IZUMO2Q6UXV1 221 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF283Q8N7M2 679 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 OR2AE1Q8NHA4 323 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 SYNPRQ8TBG9 265 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 FBLIM1Q8WUP2 373 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 RFKQ969G6 155 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 SPTSSAQ969W0 71 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 APOL4Q9BPW4 351 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 TPK1Q9H3S4 243 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 CXorf56Q9H5V9 222 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 TAAR3PQ9P1P4 343 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 DUSP13Q9UII6 198 aa9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
CNOT10-211ENST00000468599 A0A1W2PPW3 197 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 H0YJX3 145 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 H3BSA7 217 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 J3QW42 95 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 M0R233 179 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 MPZL2O60487 215 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 NCR1O76036 304 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 IGHV3-13P01766 116 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 LCATP04180 440 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 NAT2P11245 290 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 HSD11B1P28845 292 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 EVX1P49640 407 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 RGS6P49758 472 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 MMP15P51511 669 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF92Q03936 586 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 IL18R1Q13478 541 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 TAF13Q15543 124 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF718Q3SXZ3 478 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF684Q5T5D7 378 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 FBXW12Q6X9E4 464 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 OR10H4Q8NGA5 316 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF649Q9BS31 505 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 VCXQ9H320 206 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 BRD7Q9NPI1 651 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 FAM206AQ9NX38 181 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 EDARQ9UNE0 448 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 MYRFQ9Y2G1 1151 aa9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 PNPP00491 289 aa9.63□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 IGHA1P01876 353 aa9.63□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 OR2T7P0C7T2 308 aa9.63□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 KITLGP21583 273 aa9.63□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 SLC15A1P46059 708 aa9.63□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 ATP5J2P56134 94 aa9.63□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 SPRNQ5BIV9 151 aa9.63□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 Q5PR19 223 aa9.63□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 OR2T2Q6IF00 324 aa9.63□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 BRICD5Q6PL45 260 aa9.63□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 ARL9Q6T311 187 aa9.63□□□□□ -0.87
CNOT10-211ENST00000468599 Q6ZR03 302 aa9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms