RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 GSX2Q9BZM3 304 aa25.78■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 LRP12Q9Y561 859 aa25.78■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 C5orf63A6NC05 138 aa25.78■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa25.78■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 H3BSA7 217 aa25.78■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 H7C417 338 aa25.78■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 J3QRE1 110 aa25.78■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 IGHV3-13P01766 116 aa25.78■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 SLC2A1P11166 492 aa25.78■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 DBTP11182 482 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 PTH2RP49190 550 aa25.78■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 CX3CR1P49238 355 aa25.78■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 SELENOVP59797 346 aa25.78■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 SNAI3Q3KNW1 292 aa25.78■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 DEGS2Q6QHC5 323 aa25.78■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 SSX6Q7RTT6 188 aa25.78■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 PTTG3PQ9NZH4 202 aa25.78■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa25.78■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 OTOGQ6ZRI0 2925 aa25.77■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 PSG7Q13046 419 aa25.77■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 PRSS45Q7RTY3 260 aa25.77■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF679Q8IYX0 411 aa25.77■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 OR10H4Q8NGA5 316 aa25.77■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 LGALS12Q96DT0 336 aa25.77■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 PERPQ96FX8 193 aa25.77■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 FOXC2Q99958 501 aa25.77■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 MROQ9BYG7 248 aa25.77■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 TAAR3PQ9P1P4 343 aa25.77■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa25.77■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PKDCC-202ENST00000401498 PHYHO14832 338 aa25.76■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 NDUFS7O75251 213 aa25.76■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 ALDH3B1P43353 468 aa25.76■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1W2PPW3 197 aa25.75■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 APOC1P02654 83 aa25.75■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 PPOXP50336 477 aa25.75■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 ART1P52961 327 aa25.75■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 ALKBH6Q3KRA9 238 aa25.75■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 FBXW12Q6X9E4 464 aa25.75■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa25.75■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 CMBLQ96DG6 245 aa25.75■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa25.75■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 ADRA2AP08913 450 aa25.74■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 HSPA13P48723 471 aa25.74■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 HAVCR1Q96D42 359 aa25.74■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 NIPAL2Q9H841 368 aa25.74■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 DYNLRB1Q9NP97 96 aa25.74■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 IKZF2Q9UKS7 526 aa25.74■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 M0R233 179 aa25.73■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF254O75437 659 aa25.73■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 ATP5J2P56134 94 aa25.73■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF85Q03923 595 aa25.73■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 EGR3Q06889 387 aa25.73■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 CDK5R2Q13319 367 aa25.73■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 FBLIM1Q8WUP2 373 aa25.73■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 CXXC4Q9H2H0 198 aa25.73■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 BRD7Q9NPI1 651 aa25.73■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 RAC2P15153 192 aa25.73■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 NKPD1Q17RQ9 610 aa25.73■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 LAIR2Q6ISS4 152 aa25.73■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF319Q9P2F9 582 aa25.73■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 IGHV4-39P01824 125 aa25.72■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 MALLQ13021 153 aa25.72■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF684Q5T5D7 378 aa25.72■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 FAM57BQ71RH2 274 aa25.72■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 THAP5Q7Z6K1 395 aa25.72■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 OR2AE1Q8NHA4 323 aa25.72■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 SORCS2Q96PQ0 1159 aa25.72■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 MYRFQ9Y2G1 1151 aa25.72■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 NAT2P11245 290 aa25.71■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 KITLGP21583 273 aa25.71■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 DCTDP32321 178 aa25.71■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 MMP15P51511 669 aa25.71■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 RIDAP52758 137 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 PRSS12P56730 875 aa25.71■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF92Q03936 586 aa25.71■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 RAB40BQ12829 278 aa25.71■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 MOGQ16653 247 aa25.71■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 GLYATL3Q5SZD4 288 aa25.71■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PKDCC-202ENST00000401498 MS4A5Q9H3V2 200 aa25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms