RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318266.9

PTPRA-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRA, Length 3,219 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-202ENST00000318266 S1PR1P21453 382 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 GDI1P31150 447 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 SEC13P55735 322 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 ZNF616Q08AN1 781 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 OR2A2Q6IF42 318 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 LCN10Q6JVE6 187 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 DRAM2Q6UX65 266 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 C16orf52Q8NHV5 167 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 CD300LFQ8TDQ1 290 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 MAFIPQ8WZ33 124 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 ARL5BQ96KC2 179 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 VSTM2LQ96N03 204 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 NICN1Q9BSH3 213 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 RAB33BQ9H082 229 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 MAFFQ9ULX9 164 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 FANCMQ8IYD8 2048 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 A0A1W2PPE2 198 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 YKT6O15498 198 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 CT45A8P0DMV1 189 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 CT45A9P0DMV2 189 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 CTLA4P16410 223 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 ACKR3P25106 362 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 RIDAP52758 137 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 HGFACQ04756 655 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 ZNF260Q3ZCT1 412 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 CT45A2Q5DJT8 189 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 SLC18B1Q6NT16 456 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 RNF144BQ7Z419 303 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 SPRED2Q7Z698 418 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 ZNF561Q8N587 486 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 WDSUB1Q8N9V3 476 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 OR13C9Q8NGT0 318 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 OR4K15Q8NH41 348 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 APOOQ9BUR5 198 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 ABHD6Q9BV23 337 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 SLC17A9Q9BYT1 436 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 RGCCQ9H4X1 137 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 PTGES2Q9H7Z7 377 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 SPACA1Q9HBV2 294 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 LYRM4Q9HD34 91 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 POLE3Q9NRF9 147 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 WIF1Q9Y5W5 379 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 SEC16AO15027 2179 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 PRSS38A1L453 326 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 HLA-GP17693 338 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 SKP2Q13309 424 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 ZNF141Q15928 474 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 ISXQ2M1V0 245 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 GAB4Q2WGN9 574 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 CLEC18BQ6UXF7 455 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 OR52N4Q8NGI2 321 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 OR1E3Q8WZA6 343 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 FGGYQ96C11 551 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 RHOVQ96L33 236 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 OR2M4Q96R27 311 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 RNF122Q9H9V4 155 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 KNG1P01042 644 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 ASAH2BP0C7U1 165 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 SLC35E2P0CK97 266 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 FHITP49789 147 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 NAAAQ02083 359 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 UNC119Q13432 240 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 WBP2NLQ6ICG8 309 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 MED25Q71SY5 747 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 TAF8Q7Z7C8 310 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 ZNF101Q8IZC7 436 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 ZDHHC22Q8N966 263 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 AQP3Q92482 292 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 PDE7BQ9NP56 450 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 HHLA2Q9UM44 414 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 CDC14CA4D256 554 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 PMS2P1A4D2B8 440 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 MT-ND4LP03901 98 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 FCGR3AP08637 254 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 RAB5AP20339 215 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 LAP3P28838 519 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRA-202ENST00000318266 CLDN6P56747 220 aa8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms