RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 TMUB2Q71RG4 321 aa14.99□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 SLC51BQ86UW2 128 aa14.99□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa14.99□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 C8orf44Q96CB5 159 aa14.99□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 OR8B4Q96RC9 309 aa14.99□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 UMAD1C9J7I0 102 aa14.99□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 RBP4P02753 201 aa14.99□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 MEOX1P50221 254 aa14.99□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 METRNLQ641Q3 311 aa14.99□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 SLC38A9Q8NBW4 561 aa14.99□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 LRRC15Q8TF66 581 aa14.99□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 WBP2Q969T9 261 aa14.99□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 USP22Q9UPT9 525 aa14.99□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 NPTNQ9Y639 398 aa14.99□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 SPTA1P02549 2419 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 TMEM123Q8N131 208 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 OR2Z1Q8NG97 314 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 RDH5Q92781 318 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 POM121L2Q96KW2 1035 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 OPALINQ96PE5 141 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 PPIHO43447 177 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 MBP02144 154 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 GPM6AP51674 278 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 SLCO4A1Q96BD0 722 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 PPT2Q9UMR5 302 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 RNF24Q9Y225 148 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 SULT1A3P0DMM9 295 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 SULT1A4P0DMN0 295 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 ACOT8O14734 319 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 CHRDL1Q9BU40 450 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF727A8MUV8 499 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 HAAOP46952 286 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 VAMP3Q15836 100 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 PGBD5Q8N414 524 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 ELSPBP1Q96BH3 223 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF586Q9NXT0 402 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 FAM186AA6NE01 2351 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 TPBGQ13641 420 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 SPATA46Q5T0L3 261 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 SARAFQ96BY9 339 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 SLAMF6Q96DU3 332 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 GPR84Q9NQS5 396 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 CLEC2DQ9UHP7 191 aa14.98□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 FITM1A5D6W6 292 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 ST8SIA3O43173 380 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 TOX4O94842 621 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 APEX1P27695 318 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 PDXPQ96GD0 296 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 SPACA5Q96QH8 159 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 PSENENQ9NZ42 101 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 TM4SF4P48230 202 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 SMIM12Q96EX1 92 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 OR2A14Q96R47 310 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 FAM221AA4D161 298 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 CDK2AP1O14519 115 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 CHRM2P08172 466 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 IHHQ14623 411 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 ADAM5Q6NVV9 412 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 SLC16A11Q8NCK7 471 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 MOB1AQ9H8S9 216 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 SLC22A20A6NK97 555 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 OR2J2O76002 312 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 RHOBP62745 196 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 SMIM21Q3B7S5 101 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 TUSC5Q8IXB3 177 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 USF1P22415 310 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 SLCO2B1O94956 709 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 SLC25A4P12235 298 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 EMC4Q5J8M3 183 aa14.97□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 CDH26Q8IXH8 852 aa14.96□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 BCORP1Q8N888 145 aa14.96□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 TBC1D29Q9UFV1 150 aa14.96□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 F5H697 171 aa14.96□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 TAPBPO15533 448 aa14.96□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 TSPAN12O95859 305 aa14.96□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 CASP3P42574 277 aa14.96□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 CMBLQ96DG6 245 aa14.96□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa14.96□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 ASIC5Q9NY37 505 aa14.96□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 FZR1Q9UM11 496 aa14.96□□□□□ -0.01
LAMC1-201ENST00000258341 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms