RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	MUC13	Q9H3R2	512 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	POLQ	O75417	2590 aa		4.03	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	TACC2	O95359	2948 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1W2PPR1	153 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	DHRS12	A0PJE2	317 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288		E7EQL1	145 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288		H3BN98	237 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ENTPD5	O75356	428 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	PTP4A3	O75365	173 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	TIPRL	O75663	272 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	UBL3	O95164	117 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SOX14	O95416	240 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	LCK	P06239	509 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CD14	P08571	375 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	PGA4	P0DJD7	388 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	PGA3	P0DJD8	388 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CCL2	P13500	99 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CBR1	P16152	277 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	COX5A	P20674	150 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC6A6	P31641	620 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	APLNR	P35414	380 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ARR3	P36575	388 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CDKN1A	P38936	164 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	OMP	P47874	163 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	PCYT1A	P49585	367 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP5J2	P56134	94 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	DGCR6	Q14129	220 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	RAB35	Q15286	201 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ETFDH	Q16134	617 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	MICA	Q29983	383 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	RFX4	Q33E94	735 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC36A2	Q495M3	483 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	THEM4	Q5T1C6	240 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	AGAP6	Q5VW22	663 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	LCN8	Q6JVE9	175 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	LEG1	Q6P5S2	330 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SSX8	Q7RTT4	187 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC00471	Q8N535	108 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ACBD4	Q8NC06	268 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	FANK1	Q8TC84	345 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	OR52D1	Q9H346	318 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	FN3K	Q9H479	309 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CDH20	Q9HBT6	801 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	FZR1	Q9UM11	496 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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