RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OTPQ5XKR4 325 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM90A1Q86YD7 464 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LY6G5BQ8NDX9 201 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIFOQ8TCI5 191 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AJUBAQ96IF1 538 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF583Q96ND8 569 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WFDC6Q9BQY6 131 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF649Q9BS31 505 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM43Q9BTV4 400 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EMC7Q9NPA0 242 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TUBG2Q9NRH3 451 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 E9PBE3 544 aa8.21□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFA2O43678 99 aa8.21□□□□□ -1.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERPINE1P05121 402 aa8.21□□□□□ -1.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DBHP09172 617 aa8.21□□□□□ -1.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MVDP53602 400 aa8.21□□□□□ -1.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.21□□□□□ -1.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.21□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MZB1Q8WU39 189 aa8.21□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC35B4Q969S0 331 aa8.21□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TESCQ96BS2 214 aa8.21□□□□□ -1.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR52E6Q96RD3 313 aa8.21□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEPHS2Q99611 448 aa8.21□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYLK2Q9H1R3 596 aa8.21□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MEGF9Q9H1U4 602 aa8.21□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.21□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1orf123Q9NWV4 160 aa8.21□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASIC5Q9NY37 505 aa8.21□□□□□ -1.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.21□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.2□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa8.2□□□□□ -1.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C5orf58C9J3I9 102 aa8.2□□□□□ -1.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa8.2□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBXW12Q6X9E4 464 aa8.2□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COLCA1Q6ZS62 124 aa8.2□□□□□ -1.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FMO2Q99518 471 aa8.2□□□□□ -1.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRPP07492 148 aa8.19□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MSR1P21757 451 aa8.19□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRKAR1BP31321 381 aa8.19□□□□□ -1.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB25P57735 213 aa8.19□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C8orf74Q6P047 294 aa8.19□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ETV3LQ6ZN32 361 aa8.19□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa8.19□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C4orf33Q8N1A6 199 aa8.19□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5L1Q8NGL2 311 aa8.19□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDB2Q92466 427 aa8.19□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VPS33AQ96AX1 596 aa8.19□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RASD2Q96D21 266 aa8.19□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
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