RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486941.1

SNRNP40-205, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-205	ENST00000486941	MDP1	Q86V88	176 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	VRK2	Q86Y07	508 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CDK20	Q8IZL9	346 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	KDM8	Q8N371	416 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CADM2	Q8N3J6	435 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	C3orf56	Q8N813	242 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	RDH5	Q92781	318 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC35B4	Q969S0	331 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM186	Q96B77	213 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	LRR1	Q96L50	414 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR52E6	Q96RD3	313 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	PANX1	Q96RD7	426 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	C12orf10	Q9HB07	376 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	NOX3	Q9HBY0	568 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CRLF2	Q9HC73	371 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	HAO1	Q9UJM8	370 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	HMX3	A6NHT5	357 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941		M0R233	179 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	RFXANK	O14593	260 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	AIM2	O14862	343 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	BIRC5	O15392	142 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	HLA-H	P01893	362 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SERPINE1	P05121	402 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	IL6	P05231	212 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	MSMB	P08118	114 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	PRG2	P13727	222 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	IL12A	P29459	219 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CDKN2C	P42773	168 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CAPZA2	P47755	286 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC1A6	P48664	564 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CRISP3	P54108	245 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	DSTN	P60981	165 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	UFM1	P61960	85 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	LMO4	P61968	165 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ACTG1	P63261	375 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	MYBPC1	Q00872	1141 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	NPRL3	Q12980	569 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	GSG1	Q2KHT4	349 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	MMEL1	Q495T6	779 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	KRT80	Q6KB66	452 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	WDR73	Q6P4I2	378 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SNX32	Q86XE0	403 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM219	Q86XT9	240 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM123	Q8N131	208 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR6S1	Q8NH40	331 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR51F2	Q8NH61	342 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	BBS10	Q8TAM1	723 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TAAR8	Q969N4	342 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TEX37	Q96LM6	180 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF75A	Q96N20	296 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR2M2	Q96R28	347 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SORT1	Q99523	831 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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