RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393150.7

CASP4-201, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP4, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-201ENST00000393150 NDUFA2O43678 99 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 FSTL3O95633 263 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 CLIC3O95833 236 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 BCHEP06276 602 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 ETFAP13804 333 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 RHCEP18577 417 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 DSTNP60981 165 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 PAX2Q02962 417 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 RUNDC3AQ59EK9 446 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 IFT20Q8IY31 132 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 LSMEM1Q8N8F7 131 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 OR5L1Q8NGL2 311 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 NSMAFQ92636 917 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 CCDC115Q96NT0 180 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 OR52E6Q96RD3 313 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 PPA2Q9H2U2 334 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 RAD21L1Q9H4I0 556 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 EVA1AQ9H8M9 152 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 NANSQ9NR45 359 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 ASIC5Q9NY37 505 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 EMCNQ9ULC0 261 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 LOC100653049A0A140TA62 436 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 A0A1B0GWA3 101 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 CENPBD1B2RD01 187 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 TMEM233B4DJY2 109 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 H0YL77 283 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 H3BUI4 141 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 RFXANKO14593 260 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 KRT34O76011 436 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 HPRP00739 348 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 CHRNGP07510 517 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 UMPSP11172 480 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 PRG2P13727 222 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 HOXC5Q00444 222 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 PSG7Q13046 419 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 ZNF404Q494X3 552 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 ZNF774Q6NX45 483 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 ZNF101Q8IZC7 436 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 PTP4A1Q93096 173 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 MCHR2Q969V1 340 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 ERGIC1Q969X5 290 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 CMBLQ96DG6 245 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 RMND5AQ9H871 391 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 PPCSQ9HAB8 311 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.5□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 A0A0U1RQK1 487 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 A0A1B0GVI7 797 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 PRORSD1PA6NEY8 169 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 C12orf71A8MTZ7 269 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 F2RL2O00254 374 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 FMO6PO60774 539 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 ZNF32P17041 273 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 KRT4P19013 534 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 KITLGP21583 273 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 PRKAR1BP31321 381 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 WNT5AP41221 380 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 KIR2DS4P43632 304 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 SLC35A2P78381 396 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 CD47Q08722 323 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 MREGQ8N565 214 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 BBS10Q8TAM1 723 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 FNDC8Q8TC99 324 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.49□□□□□ -1.37
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CASP4-201ENST00000393150 OR14A2Q96R54 314 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 B9D2Q9BPU9 175 aa6.49□□□□□ -1.37
CASP4-201ENST00000393150 WACQ9BTA9 647 aa6.49□□□□□ -1.37
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