RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	PRRT1	Q99946	306 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	BEX2	Q9BXY8	128 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	NELFA	Q9H3P2	528 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	APMAP	Q9HDC9	416 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM206A	Q9NX38	181 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	ABI3	Q9P2A4	366 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	HSPB11	Q9Y547	144 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	C2orf72	A6NCS6	295 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	GPANK1	O95872	356 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	WNT11	O96014	354 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	UMOD	P07911	640 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	ACSM4	P0C7M7	580 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF24	P17028	368 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	CCL1	P22362	96 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	CASR	P41180	1078 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	CBX5	P45973	191 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	FMOD	Q06828	376 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	ODF4	Q2M2E3	257 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	DTX3	Q8N9I9	347 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	SPTSSA	Q969W0	71 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC25A28	Q96A46	364 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	NTNG2	Q96CW9	530 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	IP6K3	Q96PC2	410 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	TAAR9	Q96RI9	348 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	GLTP	Q9NZD2	209 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	KLK11	Q9UBX7	282 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	LAMA3	Q16787	3333 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A0U1RQV5	110 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A1B0GTH9	108 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	CIB4	A0PJX0	185 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	TNFRSF10A	O00220	468 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	TTR	P02766	147 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	QDPR	P09417	244 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF28	P17035	718 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	MPZ	P25189	248 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	SFTPD	P35247	375 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	VEGFC	P49767	419 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	RGS19	P49795	217 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	P2RY4	P51582	365 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	RAC3	P60763	192 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	H3F3A	P84243	136 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	CAMK2D	Q13557	499 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	ST3GAL2	Q16842	350 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	RAET1L	Q5VY80	246 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF627	Q7L945	461 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	KDM8	Q8N371	416 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	DEFB123	Q8N688	67 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	PP6455	Q8WZ26	134 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM54	Q969K7	222 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	ORAI1	Q96D31	301 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR137	Q96N19	417 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	GINS4	Q9BRT9	223 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR87	Q9BY21	358 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	OR10A4	Q9H209	315 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-222	ENST00000459758	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		10.23	□□□□□ -0.77

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