RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 IGSF11Q5DX21 431 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TEX30Q5JUR7 227 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 NUP54Q7Z3B4 507 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 AMER3Q8N944 861 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 NPEPL1Q8NDH3 523 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR7G2Q8NG99 324 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 NT5CQ8TCD5 201 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM106AQ96A25 262 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 RAX2Q96IS3 184 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 WDR92Q96MX6 357 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 C2orf42Q9NWW7 574 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 NUP210LQ5VU65 1888 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1B0GWA3 101 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 C5orf52A6NGY3 159 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 C10orf142B7Z368 130 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SULT2B1O00204 365 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 MFNGO00587 321 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 CPMP14384 443 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 CXCL12P48061 93 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 POU3F4P49335 361 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 CAV2P51636 162 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 CLDN12P56749 244 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SERTAD2Q14140 314 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 NFATC4Q14934 902 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 LIPNQ5VXI9 398 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 FCRLBQ6BAA4 426 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 MISPQ8IVT2 679 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 CADM4Q8NFZ8 388 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 OR2L3Q8NG85 312 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 MCHR2Q969V1 340 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ALG12Q9BV10 488 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 OPA3Q9H6K4 179 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 LYRM4Q9HD34 91 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ADAP2Q9NPF8 381 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 RAXQ9Y2V3 346 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 OR1A2Q9Y585 309 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0B4J2A0 478 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 UPK3AO75631 287 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 NTN1O95631 604 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 PNMTP11086 282 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 PSMB5P28074 263 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ABCD3P28288 659 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 PSMB10P40306 273 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 GRK6P43250 576 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 PPICP45877 212 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 HAAOP46952 286 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SLC6A9P48067 706 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 GSK3AP49840 483 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 RAB5CP51148 216 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 CD81P60033 236 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 BTN3A2P78410 334 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 IL13RA1P78552 427 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 DUSP2Q05923 314 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 MALLQ13021 153 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 OR2G2Q8NGZ5 317 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SLC22A8Q8TCC7 542 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 PAQR8Q8TEZ7 354 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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