RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366959.4

RPS6KC1-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLC22A11Q9NSA0 550 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF732B4DXR9 585 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 WDR1O75083 606 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 PPICP45877 212 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 GUCA2AQ02747 115 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 XAF1Q6GPH4 301 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 SYS1Q8N2H4 156 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR4Q3Q8NH05 313 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 BHLHE40O14503 412 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 HRH1P35367 487 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 RFC3P40938 356 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 RBP2P50120 134 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 DUSP2Q05923 314 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 HAGHQ16775 308 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 PCK2Q16822 640 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 TMEM88Q6PEY1 159 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR1S2Q8NGQ3 325 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 ELSPBP1Q96BH3 223 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 ATF6BQ99941 703 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 NIT2Q9NQR4 276 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 OBP2AQ9NY56 170 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 C17orf112F2Z3M2 114 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 CDC20Q12834 499 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 TMEM123Q8N131 208 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR13C8Q8NGS7 320 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 NEURL2Q9BR09 285 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 TPPP3Q9BW30 176 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 PRR35P0CG20 571 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 EPXP11678 715 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 PSMB6P28072 239 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 LAP3P28838 519 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 HMGN3Q15651 99 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 CALHM3Q86XJ0 350 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 OSGIN2Q9Y236 505 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 A0A096LPE4 126 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 A0A1W2PPZ6 126 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 PPP1R2P9O14990 202 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 DEGS1O15121 323 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 LHX8Q68G74 356 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 USP51Q70EK9 711 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF321PQ8N8H1 164 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR2AK2Q8NG84 335 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR2G2Q8NGZ5 317 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPACA1Q9HBV2 294 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 PRSS37A4D1T9 235 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 H2AFB1P0C5Y9 115 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR4E1P0C645 316 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 NPBWR1P48145 328 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 LCN15Q6UWW0 184 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 BAGE3Q86Y29 109 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 BAGE2Q86Y30 109 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 CDH26Q8IXH8 852 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 TBX21Q9UL17 535 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 A4GNTQ9UNA3 340 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 KIF13AQ9H1H9 1805 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 LINC01565O15544 149 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 AMER3Q8N944 861 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZBTB44Q8NCP5 570 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR6K3Q8NGY3 331 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 FBXW5Q969U6 566 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZG16BQ96DA0 208 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 TWSG1Q9GZX9 223 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 SCPEP1Q9HB40 452 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 H0Y8G0 127 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 M0R135 149 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 HLA-DOBP13765 273 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR2B8PP59922 312 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR8B8Q15620 311 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 APH1AQ96BI3 265 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF799Q96GE5 643 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 BARHL1Q9BZE3 327 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 TPOP07202 933 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 FCGR2CP31995 323 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms