RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 C1orf146Q5VVC0 180 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 ZNF544Q6NX49 715 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 LEG1Q6P5S2 330 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 UGT2A3Q6UWM9 527 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 ZNF620Q6ZNG0 422 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 DTX2Q86UW9 622 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 HS3ST5Q8IZT8 346 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 IL17RDQ8NFM7 739 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 OR4F15Q8NGB8 312 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 OR10G2Q8NGC3 310 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 OR52E2Q8NGJ4 325 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 OR8D4Q8NGM9 314 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 NMNAT3Q96T66 252 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 FEVQ99581 238 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 TSSK6Q9BXA6 273 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 CACNG6Q9BXT2 260 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 BEX2Q9BXY8 128 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 LRMDAQ9H2I8 198 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 OR51B6Q9H340 312 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 IL20Q9NYY1 176 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 DCTN6O00399 190 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 ARPC3O15145 178 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 AHCYL1O43865 530 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 MGRN1O60291 552 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 RENP00797 406 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 APEHP13798 732 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 CCNOP22674 350 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 NR4A1P22736 598 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 SERPINF1P36955 418 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 PSG4Q00888 419 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 GALK2Q01415 458 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 ADIPOQQ15848 244 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 NRN1LQ496H8 165 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 C6orf52Q5T4I8 152 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 C11orf71Q6IPW1 123 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 DPPA2Q7Z7J5 298 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 ADCK1Q86TW2 530 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 SLC30A7Q8NEW0 376 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 SDR9C7Q8NEX9 313 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 OR52L1Q8NGH7 329 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 ZNF416Q9BWM5 594 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 DGCR6LQ9BY27 220 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 FN3KQ9H479 309 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 YY1AP1Q9H869 796 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 CDH20Q9HBT6 801 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 POLE4Q9NR33 117 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 TBC1D23Q9NUY8 699 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 ARMC1Q9NVT9 282 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 DNAJB9Q9UBS3 223 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 B9D1Q9UPM9 204 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 CDH10Q9Y6N8 788 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 OR6C68A6NDL8 312 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 C12orf71A8MTZ7 269 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 EBAG9O00559 213 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 BHLHE40O14503 412 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 IDH3BO43837 385 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 GPRIN2O60269 458 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 CIB2O75838 187 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 PTHP01270 115 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 IGHV4-39P01824 125 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 CST2P09228 141 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 GSTM3P21266 225 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 MSR1P21757 451 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 STOMP27105 288 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 APLNRP35414 380 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 CCNIQ14094 377 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 RAB35Q15286 201 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 MEP1BQ16820 701 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 MSMPQ1L6U9 139 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 ZNF774Q6NX45 483 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 ASRGL1Q7L266 308 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 GLB1L2Q8IW92 636 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 OR6V1Q8N148 313 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 CYB561A3Q8NBI2 242 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 NUP37Q8NFH4 326 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 OR4Q3Q8NH05 313 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 C11orf40Q8WZ69 217 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 WNT5BQ9H1J7 359 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms