RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 TPTEP56180 551 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 TCL1AP56279 114 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 CLDN12P56749 244 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 TAS2R31P59538 309 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 RPL31P62899 125 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 GINS1Q14691 196 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 PMVKQ15126 192 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 VMACQ2NL98 169 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ASCL5Q7RTU5 278 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 CARM1Q86X55 608 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 CPNE9Q8IYJ1 553 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 DAW1Q8N136 415 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 D2HGDHQ8N465 521 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 PIK3R3Q92569 461 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 TAAR8Q969N4 342 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 PYURFQ96I23 114 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 FOPNLQ96NB1 174 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 MED18Q9BUE0 208 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 CCDC32Q9BV29 185 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 RETNQ9HD89 108 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 HRASLS2Q9NWW9 162 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 FAM206AQ9NX38 181 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 KCNS2Q9ULS6 477 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 NCOA1Q15788 1441 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 SPEF2Q9C093 1822 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 MYADML2A6NDP7 307 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF878C9JN71 531 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 CYB5BO43169 146 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF17P17021 662 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 GPX3P22352 226 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 OPRD1P41143 372 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 MAP2K4P45985 399 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 OR3A4PP47883 348 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 CFHR3Q02985 330 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF235Q14590 738 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 MLANAQ16655 118 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 CDNFQ49AH0 187 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 GPRC6AQ5T6X5 926 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 CPTPQ5TA50 214 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 PLET1Q6UQ28 207 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 CA13Q8N1Q1 262 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 TPRX1Q8N7U7 411 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 OR13J1Q8NGT2 312 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 OR1P1Q8NH06 330 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 TBCKQ8TEA7 893 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 GHSRQ92847 366 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 DUX3Q96PT4 197 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 SIGMAR1Q99720 223 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 OR10A2Q9H208 303 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 NIT2Q9NQR4 276 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 STARD5Q9NSY2 213 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 POMT2Q9UKY4 750 aa6.34□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.33□□□□□ -1.4
PDCD4-211ENST00000498367 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.33□□□□□ -1.4
PDCD4-211ENST00000498367 OR2M5A3KFT3 312 aa6.33□□□□□ -1.4
PDCD4-211ENST00000498367 RGS5O15539 181 aa6.33□□□□□ -1.4
PDCD4-211ENST00000498367 RFPL2O75678 378 aa6.33□□□□□ -1.4
PDCD4-211ENST00000498367 ATG12O94817 140 aa6.33□□□□□ -1.4
PDCD4-211ENST00000498367 TNFSF15O95150 251 aa6.33□□□□□ -1.4
PDCD4-211ENST00000498367 VENTXO95231 258 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms