RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423431.5

SPCS1-202, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SPCS1, Length 822 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-202ENST00000423431 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 GPAT3Q53EU6 434 aa7.16□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 MTX3Q5HYI7 312 aa7.16□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 MAVSQ7Z434 540 aa7.16□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF101Q8IZC7 436 aa7.16□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 SLC22A24Q8N4F4 322 aa7.16□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 OR7A2PQ8NGA2 310 aa7.16□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 C10orf82Q8WW14 230 aa7.16□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 XAGE5Q8WWM1 108 aa7.16□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 SLC35G5Q96KT7 338 aa7.16□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.16□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 NUF2Q9BZD4 464 aa7.16□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 OR51I1Q9H343 314 aa7.16□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 TCF7L2Q9NQB0 619 aa7.16□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 B3GAT1Q9P2W7 334 aa7.16□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa7.16□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 FIS1Q9Y3D6 152 aa7.16□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 SDHDO14521 159 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 PHYHO14832 338 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 CLIC3O95833 236 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 LIPFP07098 398 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 LINC00032P0C843 101 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 GKN3PP0CG01 181 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 HLA-DOBP13765 273 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 NQO1P15559 274 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 FAHP16930 419 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 SDC1P18827 310 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 CPT2P23786 658 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 COPZ1P61923 177 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 RPL38P63173 70 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 HPCAP84074 193 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 EMX2Q04743 252 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 EPS8Q12929 822 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 ATAD3BQ5T9A4 648 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 CD276Q5ZPR3 534 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF627Q7L945 461 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 SLC16A14Q7RTX9 510 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 CCDC197Q8NCU1 140 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 C19orf18Q8NEA5 215 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 MFSD8Q8NHS3 518 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 OR5P2Q8WZ92 322 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 TXNDC15Q96J42 360 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 PPP3R2Q96LZ3 170 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 OR2V2Q96R30 315 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 EBF4Q9BQW3 602 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 DPY30Q9C005 99 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 FAM107BQ9H098 131 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 SIRPDQ9H106 197 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 ATP6V1HQ9UI12 483 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 TMED5Q9Y3A6 229 aa7.15□□□□□ -1.26
SPCS1-202ENST00000423431 FTCDNL1E5RQL4 147 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 AIM2O14862 343 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 LSM1O15116 133 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 SURF4O15260 269 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 CCDC22O60826 627 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 DCTN3O75935 186 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 LAMP1P11279 417 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 LBPP18428 481 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 WNT5AP41221 380 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 CSNK1A1P48729 337 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 DGCR2P98153 550 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 KIAA0040Q15053 153 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 GSTA3Q16772 222 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF404Q494X3 552 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 SLC36A2Q495M3 483 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 C6orf136Q5SQH8 315 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 CCDC121Q6ZUS5 278 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 C6orf120Q7Z4R8 191 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 OR4K5Q8NGD3 323 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 OR2T11Q8NH01 316 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 SFXN5Q8TD22 340 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 MOAP1Q96BY2 351 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 ROPN1LQ96C74 230 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 TUBGCP3Q96CW5 907 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 LRR1Q96L50 414 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 FCRL1Q96LA6 429 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 OR52B2Q96RD2 323 aa7.14□□□□□ -1.27
SPCS1-202ENST00000423431 PRR25Q96S07 402 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms