RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 RNF121Q9H920 327 aa13.59□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 MIOXQ9UGB7 285 aa13.59□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 VPREB3Q9UKI3 123 aa13.59□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 FOXJ3Q9UPW0 622 aa13.59□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 CORO2BQ9UQ03 480 aa13.59□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa13.59□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa13.58□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 PLPP3O14495 311 aa13.58□□□□□ -0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 MMP16P51512 607 aa13.58□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 DOC2BQ14184 412 aa13.58□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 SELPLGQ14242 412 aa13.58□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 SLC36A2Q495M3 483 aa13.58□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 SLC27A4Q6P1M0 643 aa13.58□□□□□ -0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 ARMC8Q8IUR7 673 aa13.58□□□□□ -0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 BTBD10Q9BSF8 475 aa13.58□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 ASPNQ9BXN1 380 aa13.58□□□□□ -0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 TMEM27Q9HBJ8 222 aa13.58□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 ANGPT4Q9Y264 503 aa13.58□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa13.57□□□□□ -0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 H3BSA7 217 aa13.57□□□□□ -0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 FARS2O95363 451 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 OPN1SWP03999 348 aa13.57□□□□□ -0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 MAPRE2Q15555 327 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 DUSP7Q16829 419 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 NRN1LQ496H8 165 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 DNAL1Q4LDG9 190 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 RUNDC3AQ59EK9 446 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 MTX3Q5HYI7 312 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 DEFB121Q5J5C9 76 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 SLC35E4Q6ICL7 350 aa13.57□□□□□ -0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 OR4S1Q8NGB4 309 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 OR6T1Q8NGN1 323 aa13.57□□□□□ -0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 GLTPQ9NZD2 209 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 SELENONQ9NZV5 590 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 KIF17Q9P2E2 1029 aa13.57□□□□□ -0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 B2RBV5 119 aa13.56□□□□□ -0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 SERPINB7O75635 380 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF205O95201 554 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 MT-ATP6P00846 226 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV1-69P01742 117 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 CCNOP22674 350 aa13.56□□□□□ -0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 Q6ZR03 302 aa13.56□□□□□ -0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 LYG1Q8N1E2 194 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 DPP10Q8N608 796 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 C11orf65Q8NCR3 313 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 OR8B3Q8NGG8 313 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 OR5J2Q8NH18 312 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 POM121L2Q96KW2 1035 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 OR8B2Q96RD0 313 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 MCHR1Q99705 422 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM246Q9BRR3 403 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 MMP28Q9H239 520 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 CLN8Q9UBY8 286 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 SLC13A4Q9UKG4 626 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 SIGLEC9Q9Y336 463 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF879B4DU55 563 aa13.55□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 PHYHO14832 338 aa13.55□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 SERPINI2O75830 405 aa13.55□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 COX4I1P13073 169 aa13.55□□□□□ -0.24
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