RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 ZIC1Q15915 447 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF74Q16587 644 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 SYTL3Q4VX76 610 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 CST9Q5W186 159 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM64Q6YI46 380 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 Q6ZSR3 168 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 MAVSQ7Z434 540 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 C6orf120Q7Z4R8 191 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 SLC34A3Q8N130 599 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 OR5K2Q8NHB8 316 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 OR10C1Q96KK4 312 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 OR5M11Q96RB7 305 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 PECRQ9BY49 303 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ALG9Q9H6U8 611 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 TLE6Q9H808 572 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ARMCX1Q9P291 453 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.37□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 FGD5Q6ZNL6 1462 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 HACD1B0YJ81 288 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 C15orf65H3BRN8 121 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ARPC2O15144 300 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 SYNGR1O43759 233 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 CNMDO75829 334 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 CCNE2O96020 404 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ESR1P03372 595 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 TACSTD2P09758 323 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 OR13C7P0DN81 318 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ITPKBP27987 946 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 CCKARP32238 428 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 MNDAP41218 407 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF84P51523 738 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 CHN2P52757 468 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 BIDP55957 195 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 WNT4P56705 351 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 CLDN17P56750 224 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 DNAJB13P59910 316 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 GNG3P63215 75 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 BCL2L1Q07817 233 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 GPR50Q13585 617 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 OR2F1Q13607 317 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 TEAD2Q15562 447 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 TRAM1Q15629 374 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 DLK2Q6UY11 383 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 SERPINA11Q86U17 422 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 CATSPER3Q86XQ3 398 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 CADM2Q8N3J6 435 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 OR56B4Q8NH76 319 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 Q8WTZ3 238 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 FKBP10Q96AY3 582 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF503Q96F45 646 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 C14orf144Q96I85 54 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 OR2M2Q96R28 347 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 PRR25Q96S07 402 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF347Q96SE7 839 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 COPZ2Q9P299 210 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 IGSF23A1L1A6 192 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 LRIT2A6NDA9 550 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 H3BMH7 237 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 K7ERU9 68 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 RAD51CO43502 376 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 SOX15O60248 233 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ZG16O60844 167 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ANXA9O76027 345 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 TSPAN15O95858 294 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 HBE1P02100 147 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ADORA3P0DMS8 318 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 MYL12AP19105 171 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 VHLP40337 213 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 EFNA3P52797 238 aa6.35□□□□□ -1.39
PDCD4-211ENST00000498367 CRISP1P54107 249 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms