RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360954.2

HS3ST3B1-201, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HS3ST3B1, Length 5,367 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST3B1-201ENST00000360954 BTG2P78543 158 aa14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FAM71CQ8NEG0 241 aa14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SCARB1Q8WTV0 552 aa14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SSX3Q99909 188 aa14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR6C6A6NF89 314 aa14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RRP8O43159 456 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TBXA2RP21731 343 aa14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MYO9BQ13459 2157 aa14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 VWA2Q5GFL6 755 aa14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC22A11Q9NSA0 550 aa14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SERPINA7P05543 415 aa14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCR6P51684 374 aa14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIAA0040Q15053 153 aa14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TSLPQ969D9 159 aa14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.8□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR5T1Q8NG75 326 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR4D6Q8NGJ1 314 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR10K1Q8NGX5 313 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLAMF9Q96A28 289 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SARAFQ96BY9 339 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IL20Q9NYY1 176 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 A0A1B0GTL3 188 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 M0QYG6 137 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GABRG2P18507 467 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CACFD1Q9UGQ2 172 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR2F2O95006 317 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR2F1Q13607 317 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PXT1Q8NFP0 134 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NTN4Q9HB63 628 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SNRPGP15A8MWD9 76 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 M0R135 149 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PMP2P02689 132 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC25A1P53007 311 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 C11orf40Q8WZ69 217 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF799Q96GE5 643 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 EGLN1Q9GZT9 426 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 A0A087WUJ7 227 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CBR3O75828 277 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RNF4P78317 190 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OGFOD3Q6PK18 319 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.79□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 A0A0B4J2A0 478 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DEGS1O15121 323 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FBXO24O75426 580 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FUCA1P04066 466 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 AADACP22760 399 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LRRC61Q9BV99 259 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ASH2LQ9UBL3 628 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HRH3Q9Y5N1 445 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 C2CD4DB7Z1M9 353 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SHBQ15464 509 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CD300LDQ6UXZ3 194 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR1N1Q8NGS0 311 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR52I2Q8NH67 350 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 A4GNTQ9UNA3 340 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC2A10O95528 541 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ALKAL2Q6UX46 152 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ATF6BQ99941 703 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 POFUT1Q9H488 388 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MYO10Q9HD67 2058 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIR2DL3P43628 341 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR1S2Q8NGQ3 325 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SEC22AQ96IW7 307 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RNF170Q96K19 258 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PLK3Q9H4B4 646 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GPATCH2Q9NW75 528 aa14.78□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 STMND1H3BQB6 276 aa14.77□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 APEHP13798 732 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FABP5Q01469 135 aa14.77□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC10A1Q14973 349 aa14.77□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GABRG1Q8N1C3 465 aa14.77□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 C12orf10Q9HB07 376 aa14.77□□□□□ -0.04
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FOXJ3Q9UPW0 622 aa14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms