RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 SHISA9B4DS77 424 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 PLPP3O14495 311 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 SDHAP31040 664 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLC37A3Q8NCC5 494 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 LGALS12Q96DT0 336 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 KATNB1Q9BVA0 655 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 TAPBPLQ9BX59 468 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa21.1■□□□□ 0.97
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CAPNS1-216ENST00000628306 IL32P24001 234 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 GRPRP30550 384 aa21.1■□□□□ 0.97
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CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM158Q8WZ71 300 aa21.1■□□□□ 0.97
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CAPNS1-216ENST00000628306 RNFT2Q96EX2 444 aa21.1■□□□□ 0.97
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CAPNS1-216ENST00000628306 OR11A1Q9GZK7 315 aa21.1■□□□□ 0.97
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CAPNS1-216ENST00000628306 A8MV72 311 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 H3BSA7 217 aa21.1■□□□□ 0.97
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35D3Q5M8T2 416 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 PDSS1Q5T2R2 415 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10H5Q8NGA6 315 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 OR52E2Q8NGJ4 325 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 OR52I1Q8NGK6 324 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A36Q96CQ1 311 aa21.1■□□□□ 0.97
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CAPNS1-216ENST00000628306 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6A2O95222 327 aa21.09■□□□□ 0.97
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLC2A5P22732 501 aa21.09■□□□□ 0.97
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CAPNS1-216ENST00000628306 INPP5EQ9NRR6 644 aa21.08■□□□□ 0.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 M0R082 166 aa21.07■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 DNPH1O43598 174 aa21.07■□□□□ 0.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 PMS2P2O95744 297 aa21.07■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 F12P00748 615 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHA1P01876 353 aa21.07■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM157CP0CG43 387 aa21.07■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 ADORA3P0DMS8 318 aa21.07■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 OR3A2P47893 321 aa21.07■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM205BPQ63HN1 556 aa21.07■□□□□ 0.96
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