RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 WDR73Q6P4I2 378 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 VWA1Q6PCB0 445 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 NRGNQ92686 78 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 MOAP1Q96BY2 351 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 OR11A1Q9GZK7 315 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 POLE3Q9NRF9 147 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 GRHPRQ9UBQ7 328 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 DUXAA6NLW8 204 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF264O43296 627 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 WDR1O75083 606 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 LGI1O95970 557 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 PRG2P13727 222 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF708P17019 499 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 APEX1P27695 318 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 KIR2DL3P43628 341 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 RPS5P46782 204 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP10-9P60411 292 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 CHMP1BQ7LBR1 199 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 LHFPL3Q86UP9 236 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 GLCCI1Q86VQ1 547 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 ENKURQ8TC29 256 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 PRRG3Q9BZD7 231 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 PRDM14Q9GZV8 571 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0J9YW62 118 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00587B1AMM8 73 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 PLA2G10O15496 165 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 PRODHO43272 600 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 CH25HO95992 272 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 IL2RAP01589 272 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 CDK5Q00535 292 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 FABP5Q01469 135 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 KLHL22Q53GT1 634 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 C1orf94Q6P1W5 598 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM81Q6P7N7 255 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 P4HA3Q7Z4N8 544 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 GDPD1Q8N9F7 314 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 OR8D4Q8NGM9 314 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 UFD1Q92890 307 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 PRRC1Q96M27 445 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A087WUU8 490 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 CASKO14936 926 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 LALBAP00709 142 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 CHRNB4P30926 498 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 MTNR1AP48039 350 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 SKP2Q13309 424 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 PAMR1Q6UXH9 720 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 GGNQ86UU5 652 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 RDH10Q8IZV5 341 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 PLPP7Q8NBV4 271 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 OR10D3Q8NH80 312 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF563Q8TA94 476 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM163Q8TC26 289 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 PIGQQ9BRB3 760 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 SAP130Q9H0E3 1048 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 RNF121Q9H920 327 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNJ16Q9NPI9 418 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 NCR1O76036 304 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 LIMS3P0CW19 117 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 LIMS4P0CW20 117 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 DLX5P56178 289 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB40BQ12829 278 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 INSL4Q14641 139 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC25A30Q5SVS4 291 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC27A4Q6P1M0 643 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 CD300LDQ6UXZ3 194 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF730Q6ZMV8 503 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 NOXA1Q86UR1 476 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 PM20D2Q8IYS1 436 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 CADM2Q8N3J6 435 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 GPR119Q8TDV5 335 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 UCN2Q96RP3 112 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 TMED9Q9BVK6 235 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 ZFHX3Q15911 3703 aa11.15□□□□□ -0.63
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM129A0AVI4 362 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC22A20A6NK97 555 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-209ENST00000607882 ACTL6AO96019 429 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-209ENST00000607882 GABRA1P14867 456 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-209ENST00000607882 TAS2R41P59536 307 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-209ENST00000607882 EFNB1P98172 346 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-209ENST00000607882 TPBGQ13641 420 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-209ENST00000607882 P2RY14Q15391 338 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-209ENST00000607882 Q5BKY6 102 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-209ENST00000607882 ENTPD8Q5MY95 495 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-209ENST00000607882 CNIH2Q6PI25 160 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-209ENST00000607882 MCEMP1Q8IX19 187 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-209ENST00000607882 OR4F15Q8NGB8 312 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-209ENST00000607882 ABHD3Q8WU67 409 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-209ENST00000607882 AP3S1Q92572 193 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-209ENST00000607882 RNF170Q96K19 258 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms