RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557758.1

PRMT5-227, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, human

TSL 3

Gene PRMT5, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT5-227	ENST00000557758	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	TBX15	Q96SF7	602 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	CALN1	Q9BXU9	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	GBA3	Q9H227	469 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	RBKS	Q9H477	322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	EURL	Q9NYK6	297 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	MLX	Q9UH92	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	TBX21	Q9UL17	535 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	TMCO1	Q9UM00	188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	COPS3	Q9UNS2	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758		F8VP50	259 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	RFXANK	O14593	260 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ENTPD5	O75356	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	KRT7	P08729	469 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	CD48	P09326	243 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PRSS56	P0CW18	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	GABRR2	P28476	465 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PDHA2	P29803	388 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	NBL1	P41271	181 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ATP4B	P51164	291 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	CRISP1	P54107	249 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	SKP1	P63208	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	TSC22D1	Q15714	1073 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PSG3	Q16557	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	EMB	Q6PCB8	327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ARC	Q7LC44	396 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	DEFB106A	Q8N104	65 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	STMN2	Q93045	179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	LRRC45	Q96CN5	670 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	TMEM80	Q96HE8	168 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	CENPH	Q9H3R5	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PIGU	Q9H490	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	BEX1	Q9HBH7	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	RETN	Q9HD89	108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	MARCH5	Q9NX47	278 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PATJ	Q8NI35	1801 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758		E7ESA3	106 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	SULT2B1	O00204	365 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ATP8B1	O43520	1251 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	IGHG1	P01857	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	GLA	P06280	429 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	HSD17B1	P14061	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	MGMT	P16455	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	CTRB1	P17538	263 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	BCL3	P20749	454 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	MIP	P30301	263 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PTGDS	P41222	190 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ELK3	P41970	407 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	CRAT	P43155	626 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	GPR1	P46091	355 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PSMD5	Q16401	504 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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