RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484918.1

MRPL23-209, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, human

TSL 5

Gene MRPL23, Length 232 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL23-209	ENST00000484918	PDPK1	O15530	556 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	UGDH	O60701	494 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	OXT	P01178	125 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	IFNB1	P01574	187 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF43	P17038	809 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	STOM	P27105	288 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	RAD23A	P54725	363 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	ZBED6	P86452	979 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	SMU1	Q2TAY7	513 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	CARD17	Q5XLA6	110 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF563	Q8TA94	476 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	CDS1	Q92903	461 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	CD274	Q9NZQ7	290 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	OPTC	Q9UBM4	332 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	OOEP	A6NGQ2	149 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	IGLL5	B9A064	214 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	RHBDL1	O75783	438 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	CSTA	P01040	98 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	PNMT	P11086	282 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	IRF2	P14316	349 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	ATP6V1C1	P21283	382 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	MAPK1	P28482	360 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	CXCR5	P32302	372 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	PGM1	P36871	562 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	HTR3A	P46098	478 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	ENTPD1	P49961	510 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	MAP2K6	P52564	334 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	CLRN1	P58418	232 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	SSX2	Q16385	188 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	HHAT	Q5VTY9	493 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	NXN	Q6DKJ4	435 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918		Q6ZRM9	215 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	MKX	Q8IYA7	352 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	TEX9	Q8N6V9	391 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	OXGR1	Q96P68	337 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	DERL2	Q9GZP9	239 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	PSAT1	Q9Y617	370 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	SCN2B	O60939	215 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF75D	P51815	510 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	LGALS4	P56470	323 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	ZP1	P60852	638 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	HSF2	Q03933	536 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF616	Q08AN1	781 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	FOXE3	Q13461	319 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	OR8B8	Q15620	311 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	MPPED2	Q15777	294 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF141	Q15928	474 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	DCST2	Q5T1A1	773 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	C10orf111	Q8N326	155 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		4.72	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms