RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368147.8

SPTA1-201, Transcript of spectrin alpha, erythrocytic 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTA1, Length 7,999 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Dendrite .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1-201ENST00000368147 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 ISOC1Q96CN7 298 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 C1orf198Q9H425 327 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 VAPAQ9P0L0 249 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 STRCQ7RTU9 1775 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 A0A1W2PNR3 127 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 MPLP40238 635 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 TAS2R60P59551 318 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 GPR176Q14439 515 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 MICAQ29983 383 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 DTD1Q8TEA8 209 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 F5P12259 2224 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 A0A0B4J2A0 478 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 DEGS1O15121 323 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 GPR75O95800 540 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 TSPAN12O95859 305 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 OMGP23515 440 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 AOAHP28039 575 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 HTR2CP28335 458 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 TIFABQ6ZNK6 161 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF573Q86YE8 665 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 GPA33Q99795 319 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 PIGMQ9H3S5 423 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 LHX6Q9UPM6 363 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF728P0DKX0 622 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 C7P10643 843 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 CST5P28325 142 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 TPPP2P59282 170 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 ST8SIA4Q92187 359 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 SOX7Q9BT81 388 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF814B7Z6K7 855 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 LMX1BO60663 402 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 TK1P04183 234 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 HOXB5P09067 269 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 CD1CP29017 333 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 PRSS3P35030 304 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 DLX5P56178 289 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 RAB1AP62820 205 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 GPLD1P80108 840 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 GRINAQ7Z429 371 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 OR6V1Q8N148 313 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 OR4K5Q8NGD3 323 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 PFN4Q8NHR9 129 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 BORCS6Q96GS4 357 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 V9GYS6 101 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 A0A1W2PRD5 423 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 A0A1W2PRF3 423 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 A0A1W2PRM7 423 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 A6NDN8 102 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 BMPR1BO00238 502 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 P2RY10O00398 339 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 IL3RAP26951 378 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 KCNJ8Q15842 424 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 C14orf79Q96F83 325 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 RNF150Q9ULK6 438 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 TIAM2Q8IVF5 1701 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 TMEM235A6NFC5 223 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 OOEPA6NGQ2 149 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 MMP2P08253 660 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 GM2AP17900 193 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF77Q15935 545 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 TIGITQ495A1 244 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTA1-201ENST00000368147 CCSMST1Q4G0I0 132 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms