RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 STARP49675 285 aa20.23■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 DEFA1P59665 94 aa20.23■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 DEFA3P59666 94 aa20.23■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 GGNQ86UU5 652 aa20.23■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 UBQLNLQ8IYU4 475 aa20.23■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 DTX3Q8N9I9 347 aa20.23■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 CLEC1AQ8NC01 280 aa20.23■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 OR5H6Q8NGV6 325 aa20.23■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 RHBDL2Q9NX52 303 aa20.23■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 ABI3Q9P2A4 366 aa20.23■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 EXTL2Q9UBQ6 330 aa20.23■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 CDRT15L2A8MXV6 281 aa20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 PTTG1O95997 202 aa20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 CCR9P51686 369 aa20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 OR1C1Q15619 314 aa20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 C11orf91Q3C1V1 193 aa20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 LRFN4Q6PJG9 635 aa20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 GDPD3Q7L5L3 318 aa20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 TMPRSS12Q86WS5 348 aa20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 IL17RDQ8NFM7 739 aa20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 GPR148Q8TDV2 347 aa20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 KCNE4Q8WWG9 221 aa20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 EMC7Q9NPA0 242 aa20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 SSX4O60224 188 aa20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 TAB1Q15750 504 aa20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 OR2M7Q8NG81 312 aa20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 OR9K2Q8NGE7 335 aa20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 CENPMQ9NSP4 180 aa20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1B0GVC2 190 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 A6NIN4 97 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 NPIPA2E9PIF3 369 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 NPIPA3F8WFD2 350 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 GPR171O14626 319 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 VAMP5O95183 116 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 BCAP31P51572 246 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 CATSPERDQ86XM0 798 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM106AQ96A25 262 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 TCF7L1Q9HCS4 588 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 BRD7Q9NPI1 651 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 CYSLTR2Q9NS75 346 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 EMC9Q9Y3B6 208 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 DMXL1Q9Y485 3027 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF432O94892 652 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 RAC3P60763 192 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 CDC20Q12834 499 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 POU4F3Q15319 338 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 STAC2Q6ZMT1 411 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 OR4M1Q8NGD0 313 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 RNF133Q8WVZ7 376 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 FAM173AQ9BQD7 235 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 OR2B2Q9GZK3 357 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 CLEC4AQ9UMR7 237 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 R4GMQ9 66 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM4-201ENST00000298454 PDCD5O14737 125 aa20.2■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 PHYHD1Q5SRE7 291 aa20.2■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 HES5Q5TA89 166 aa20.2■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 SULF2Q8IWU5 870 aa20.2■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 OR2M2Q96R28 347 aa20.2■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 GLTPQ9NZD2 209 aa20.2■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 LHFPL6Q9Y693 200 aa20.2■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0G2JMP0 313 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0X1KG70 313 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 DOK2O60496 412 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 NPR2P20594 1047 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 CD82P27701 267 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 CARD18P57730 90 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 Q8N402 240 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 OR4M2Q8NGB6 313 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 SLAMF6Q96DU3 332 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 ABRACLQ9P1F3 81 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 A6NL46 340 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 H2BFMP0C1H6 154 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 ADRA2CP18825 462 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 CLDN15P56746 228 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 CFAP77Q6ZQR2 320 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 VASH2Q86V25 355 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 ZIC4Q8N9L1 334 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 OR10S1Q8NGN2 331 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms