RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 MACROD1Q9BQ69 325 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 FBP1P09467 338 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 AMTP48728 403 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 C17orf99Q6UX52 265 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 CHST11Q9NPF2 352 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
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CUX1-201ENST00000292535 AK3Q9UIJ7 227 aa8.57□□□□□ -1.04
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CUX1-201ENST00000292535 HLA-FP30511 346 aa8.57□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 TNFSF8P32971 234 aa8.57□□□□□ -1.04
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CUX1-201ENST00000292535 C14orf79Q96F83 325 aa8.57□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
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CUX1-201ENST00000292535 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa8.57□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 MARC2Q969Z3 335 aa8.57□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 ATOH8Q96SQ7 321 aa8.57□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 GAREM1Q9H706 876 aa8.57□□□□□ -1.04
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CUX1-201ENST00000292535 E5RGE8 158 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 CSO75390 466 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 SOX18P35713 384 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 HSPB2Q16082 182 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 RAB6CQ53S08 254 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 CLDN22Q8N7P3 220 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 CTRCQ99895 268 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 QPCTLQ9NXS2 382 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 NTNG1Q9Y2I2 539 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 SMLR1H3BR10 107 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 COX7A2P2O60397 106 aa8.56□□□□□ -1.04
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