RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGDIGQ99819 225 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM106BQ9NUM4 274 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 VAPAQ9P0L0 249 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 CORO2BQ9UQ03 480 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 EVPLLA8MZ36 301 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC2A10O95528 541 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ADH4P08319 380 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 RBMXP38159 391 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR4P57081 412 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST3H3Q16695 136 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ESCO2Q56NI9 601 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 OR52E2Q8NGJ4 325 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 OR6T1Q8NGN1 323 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TMIGD2Q96BF3 282 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 IKZF5Q9H5V7 419 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC100509620A0A075B734 347 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 CLDN34H7C241 214 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 MGRN1O60291 552 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TRMUO75648 421 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ASAH2BP0C7U1 165 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ACADSP16219 412 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC6A9P48067 706 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TAF11Q15544 211 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 NPTX1Q15818 432 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 MREGQ8N565 214 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 NSMAFQ92636 917 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 SPDL1Q96EA4 605 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 CD55P08174 381 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 VIMP08670 466 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFSF4P23510 183 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 DAP3P51398 398 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ERVK-25P63136 954 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM155Q4W5P6 130 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 MTX3Q5HYI7 312 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 PAGE3Q5JUK9 113 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 C10orf128Q5T292 105 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 PARP8Q8N3A8 854 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ASB10Q8WXI3 467 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM120BA0PK00 339 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAPPC13A5PLN9 417 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TGDSO95455 350 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 KNG1P01042 644 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 THY1P04216 161 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGDIAP52565 204 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 BTG1P62324 171 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 PSG4Q00888 419 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 CD47Q08722 323 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 DUSP7Q16829 419 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 C17orf107Q6ZR85 190 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf174Q8IYL3 243 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 MPP4Q96JB8 637 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 NANOGQ9H9S0 305 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 INIPQ9NRY2 104 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC167Q9P0B6 97 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 CENPBD1B2RD01 187 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 LYPD3O95274 346 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 NGFP01138 241 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 UGT2B15P54855 530 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 C16orf87Q6PH81 154 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ZER1Q7Z7L7 766 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR32P1Q8NGA4 272 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 NABP1Q96AH0 204 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ELOVL3Q9HB03 270 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 A8MXK9 166 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BSA7 217 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 GPX2P18283 190 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFRSF1AP19438 455 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 FMODQ06828 376 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ZMYND11Q15326 602 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 BTNL3Q6UXE8 466 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf65Q8NCR3 313 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2Z1Q8NG97 314 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 CCT8L2Q96SF2 557 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 SEPHS2Q99611 448 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2H1Q9GZK4 316 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 USH1CQ9Y6N9 552 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-217ENST00000629983 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 M0QX08 132 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CD247P20963 164 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 AQP2P41181 271 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP51A1Q16850 503 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR93Q6P2C0 686 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 FUNDC1Q8IVP5 155 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF283Q8N7M2 679 aa23.01■■□□□ 1.27
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