RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560983.1

HERC1-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene HERC1, Length 457 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-211ENST00000560983 ZNF101Q8IZC7 436 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 OR2L13Q8N349 312 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 METTL4Q8N3J2 472 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 L3MBTL4Q8NA19 623 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 C1orf54Q8WWF1 131 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 LRRC39Q96DD0 335 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 ELP4Q96EB1 424 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 CCDC126Q96EE4 140 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 SERPINI1Q99574 410 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 PCGF1Q9BSM1 259 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 TRIM15Q9C019 465 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 NMUR2Q9GZQ4 415 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 EXD2Q9NVH0 621 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 DUX4Q9UBX2 424 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 KCNG2Q9UJ96 466 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 ACOT9Q9Y305 439 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 RNF11Q9Y3C5 154 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 DOCK11Q5JSL3 2073 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 ZNF587BE7ETH6 402 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 P2RY10O00398 339 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 RAMP3O60896 148 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 GUCY1B2O75343 617 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 NUDT14O95848 222 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 IGHV3-13P01766 116 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 HLA-HP01893 362 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 OPN1SWP03999 348 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 OR8G3PP0DMU2 310 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 MLNP12872 115 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 CPT2P23786 658 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 IVDP26440 423 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 LCN1P31025 176 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 MPIP34949 423 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 CETN2P41208 172 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 MAGEA3P43357 314 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 MMP15P51511 669 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 TERF1P54274 439 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 OR2B6P58173 313 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 ERVS71-1P61550 626 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 RPS23P62266 143 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 BTG1P62324 171 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 TTMPQ5BVD1 217 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 FAM45BPQ6NSW5 357 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 NHLRC1Q6VVB1 395 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 ZNF841Q6ZN19 808 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 ZNF329Q86UD4 541 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 EPHX4Q8IUS5 362 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 ZNF584Q8IVC4 421 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 TXLNBQ8N3L3 684 aa3□□□□□ -1.93
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HERC1-211ENST00000560983 CCDC89Q8N998 374 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 SPERTQ8NA61 448 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 OR9K2Q8NGE7 335 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 OR5W2Q8NH69 310 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 OR2T6Q8NHC8 308 aa3□□□□□ -1.93
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HERC1-211ENST00000560983 SYNPRQ8TBG9 265 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 FAM45AQ8TCE6 357 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 GPR151Q8TDV0 419 aa3□□□□□ -1.93
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HERC1-211ENST00000560983 ISOC1Q96CN7 298 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 GIMAP5Q96F15 307 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 ITCHQ96J02 903 aa3□□□□□ -1.93
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HERC1-211ENST00000560983 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 ATOH8Q96SQ7 321 aa3□□□□□ -1.93
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HERC1-211ENST00000560983 CCDC106Q9BWC9 280 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 OR11A1Q9GZK7 315 aa3□□□□□ -1.93
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HERC1-211ENST00000560983 C3orf14Q9HBI5 128 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 SERINC1Q9NRX5 453 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 TMEM106BQ9NUM4 274 aa3□□□□□ -1.93
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HERC1-211ENST00000560983 GRHL1Q9NZI5 618 aa3□□□□□ -1.93
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HERC1-211ENST00000560983 TMEM181Q9P2C4 612 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 TRAPPC4Q9Y296 219 aa3□□□□□ -1.93
HERC1-211ENST00000560983 LRCH1Q9Y2L9 728 aa3□□□□□ -1.93
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