RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560353.1

APH1B-208, Transcript of aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit, humanhuman

TSL 3

Gene APH1B, Length 672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1B-208ENST00000560353 PHYHO14832 338 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 PEX11AO75192 247 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 FSTL3O95633 263 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 PRG2P13727 222 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 STOMP27105 288 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 WNT5AP41221 380 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 PPP1CBP62140 327 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 HSF2Q03933 536 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 LIN52Q52LA3 116 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 CASC10Q5T4H9 136 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 IL23RQ5VWK5 629 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 CD276Q5ZPR3 534 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 KANK2Q63ZY3 851 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 PXKQ7Z7A4 578 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 VRK2Q86Y07 508 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 LYG1Q8N1E2 194 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 SCAIQ8N9R8 606 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 C10orf82Q8WW14 230 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 TMEM54Q969K7 222 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 SLC41A3Q96GZ6 507 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 WDFY2Q96P53 400 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 TMEM246Q9BRR3 403 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 GLTPQ9NZD2 209 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 DCDC2Q9UHG0 476 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 C5orf49A4QMS7 147 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 GHRHP01286 108 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 FBP1P09467 338 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 NR2F1P10589 423 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 MMP9P14780 707 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 CBLP22681 906 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 CRATP43155 626 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 KIR2DS4P43632 304 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 COX10Q12887 443 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 METTL11BQ5VVY1 283 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 OR4F3Q6IEY1 312 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 ZNF836Q6ZNA1 936 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 OR52P1PQ8NH57 321 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 OR5R1Q8NH85 324 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 ABHD4Q8TB40 342 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 ITLN1Q8WWA0 313 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 LHX4Q969G2 390 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 C3orf30Q96M34 536 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 C1orf50Q9BV19 199 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 ASPNQ9BXN1 380 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 PPA2Q9H2U2 334 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 ARMC7Q9H6L4 198 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 C12orf10Q9HB07 376 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 GCM1Q9NP62 436 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 GIMAP2Q9UG22 337 aa8.49□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 C22orf46C9J442 243 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 ZSCAN12O43309 604 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 SASH3O75995 380 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 ZNF205O95201 554 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 FGF4P08620 206 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 GDI2P50395 445 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 BIDP55957 195 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 CLDN8P56748 225 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 PUDPQ08623 228 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 PSG7Q13046 419 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 ZNF404Q494X3 552 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 C6orf136Q5SQH8 315 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 RNF220Q5VTB9 566 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 DTX3Q8N9I9 347 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 FNDC5Q8NAU1 212 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 SPATA4Q8NEY3 305 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 OR8J2Q8NGG1 315 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 OR4C13Q8NGP0 309 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 OR6S1Q8NH40 331 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 OR6X1Q8NH79 312 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 TWIST2Q8WVJ9 160 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 POM121L2Q96KW2 1035 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 OR2V2Q96R30 315 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 SLC35A5Q9BS91 424 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.48□□□□□ -1.05
APH1B-208ENST00000560353 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67 ms