RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	LYPD3	O95274	346 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	PTH	P01270	115 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	LOXL3	P58215	753 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	HSF2	Q03933	536 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	PDCD1	Q15116	288 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	MTX3	Q5HYI7	312 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ABHD4	Q8TB40	342 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	DYRK2	Q92630	601 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	TBX15	Q96SF7	602 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	GCM1	Q9NP62	436 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	TLDC2	A0PJX2	215 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	WDR91	A4D1P6	747 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	SLC2A10	O95528	541 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	OPN1MW	P04001	364 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	CSF1	P09603	554 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	MMP9	P14780	707 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	PRKAR1B	P31321	381 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	PMEL	P40967	661 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	MMP16	P51512	607 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	OGFOD2	Q6N063	350 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	IFT20	Q8IY31	132 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF607	Q96SK3	696 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	SEPHS2	Q99611	448 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	C16orf95	Q9H693	158 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	NANOG	Q9H9S0	305 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	PNPO	Q9NVS9	261 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	SDHD	O14521	159 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	ICMT	O60725	284 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	KRT34	O76011	436 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	CH25H	O95992	272 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	BMP2	P12643	396 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	LIPA	P38571	399 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	IER3	P46695	156 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	GNB2	P62879	340 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	ERVK-25	P63136	954 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	RGN	Q15493	299 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF74	Q16587	644 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	NRN1L	Q496H8	165 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	HIPK4	Q8NE63	616 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	ITPKC	Q96DU7	683 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	OR2V2	Q96R30	315 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	EPYC	Q99645	322 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	SIAE	Q9HAT2	523 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557		A0A0U1RQK1	487 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	RNF13	O43567	381 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	TYROBP	O43914	113 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	PIP5K1C	O60331	668 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BBS1-222	ENST00000533557	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8

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