RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 INIPQ9NRY2 104 aa6.27□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.27□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 DUSP13Q9UII6 198 aa6.27□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 BAG5Q9UL15 447 aa6.27□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 H7C1C5 153 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 CDC42EP2O14613 210 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 LMX1BO60663 402 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 NCR1O76036 304 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 PDE5AO76074 875 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 DIRAS1O95057 198 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 PRSS23O95084 383 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 UBL3O95164 117 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 RAB36O95755 333 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF682O95780 498 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 SERPINA1P01009 418 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 TGFAP01135 160 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 NPPAP01160 153 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF32P17041 273 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 PAX7P23759 505 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 IGFBP5P24593 272 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 RBM34P42696 430 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 MAGEB1P43366 347 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 PSME3P61289 254 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 LCN6P62502 163 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 RIN1Q13671 783 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 MAPRE2Q15555 327 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 SPRNQ5BIV9 151 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 NRMQ8IXM6 262 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 RNF148Q8N7C7 305 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM86B1Q8N7N1 296 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 NOXO1Q8NFA2 376 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 IL17RDQ8NFM7 739 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 RASSF5Q8WWW0 418 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 SEPHS2Q99611 448 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 NARFLQ9H6Q4 476 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 CHODLQ9H9P2 273 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 MED31Q9Y3C7 131 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 A0A1W2PRG6 482 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 VSTM5A8MXK1 200 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 MCIDASD6RGH6 385 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 GSTA4O15217 222 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 SYNGR3O43761 229 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 IFNA14P01570 189 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 IGHG1P01857 330 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 CSF3P09919 207 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF23P17027 643 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 DRD4P21917 467 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 CCNOP22674 350 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 GIFP27352 417 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 MPV17P39210 176 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 WNT5AP41221 380 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 GPR4P46093 362 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 ERVK-25P63136 954 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 PSG4Q00888 419 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 GLO1Q04760 184 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 PRKCDQ05655 676 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 ST3GAL3Q11203 375 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 ALG10Q5BKT4 473 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 C10orf128Q5T292 105 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 GLYATQ6IB77 296 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM53Q6P2H8 277 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF786Q8N393 782 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 PRRC1Q96M27 445 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 Q96M85 177 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 GPA33Q99795 319 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 FNDC11Q9BVV2 318 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM107BQ9H098 131 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 WNT5BQ9H1J7 359 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 POFUT1Q9H488 388 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 TREM2Q9NZC2 230 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 FKBP7Q9Y680 259 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 CACNG2Q9Y698 323 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF4B-208ENST00000490653 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.25□□□□□ -1.41
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