RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 DPYSL2Q16555 572 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 TSTQ16762 297 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 CHRFAM7AQ494W8 412 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 RAB6CQ53S08 254 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 ELFN2Q5R3F8 820 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF678Q5SXM1 525 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 ARL14Q8N4G2 192 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 OR4C15Q8NGM1 316 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 ST7LQ8TDW4 575 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 PHYHIPLQ96FC7 376 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 TEX37Q96LM6 180 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 PI4K2AQ9BTU6 479 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 TMEM100Q9NV29 134 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 DUX4Q9UBX2 424 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 CYTH4Q9UIA0 394 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 UBR3Q6ZT12 1888 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 AZIN1O14977 448 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 SLC16A4O15374 487 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 DLEU1O43261 78 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 LANCL1O43813 399 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 MPZL2O60487 215 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 SLC19A2O60779 497 aa3.05□□□□□ -1.92
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