RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 TAOK1Q7L7X3 1001 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF653Q96CK0 615 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CFAP57Q96MR6 1250 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 TMED10P49755 219 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 COG7P83436 770 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ICA1Q05084 483 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC30Q5VVM6 783 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 PHC3Q8NDX5 983 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CCT5P48643 541 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 EVCP57679 992 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 LZTS2Q9BRK4 669 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 MAF1Q9H063 256 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 IL16Q14005 1332 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SKOR1P84550 965 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SEPT8Q92599 483 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SMC6Q96SB8 1091 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 TMCC1O94876 653 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 COPB2P35606 906 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 STK3Q13188 491 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ISM2Q6H9L7 571 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SIX5Q8N196 739 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC148Q8NFR7 591 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 BCAS4Q8TDM0 211 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 TNMDQ9H2S6 317 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 RHBDL2Q9NX52 303 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CEP126Q9P2H0 1117 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SLC26A4O43511 780 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 MCM2P49736 904 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 KIF5AQ12840 1032 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 MSANTD4Q8NCY6 345 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CASP10Q92851 521 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 RASSF10A6NK89 507 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 IMPDH2P12268 514 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 FERP16591 822 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF394Q53GI3 561 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 FLCNQ8NFG4 579 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CEP63Q96MT8 703 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 FIBPO43427 364 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CETN2P41208 172 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ARMC3Q5W041 872 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 MFN1Q8IWA4 741 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 LZICQ8WZA0 190 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 VMP1Q96GC9 406 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ELP1O95163 1332 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 MAP7D3Q8IWC1 876 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 IFT74Q96LB3 600 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 TTC1Q99614 292 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 H0YC42 278 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ATP6V1G1O75348 118 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 TUBA1BP68363 451 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 UBE4AQ14139 1066 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 TUBA1AQ71U36 451 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CTAGE6Q86UF2 777 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 TSG101Q99816 390 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 JADE2Q9NQC1 790 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 DISC1Q9NRI5 854 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 HSF2BPO75031 334 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 MAP3K11Q16584 847 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms