RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 WWC2Q6AWC2 1192 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC91Q7Z6B0 441 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 PLBD2Q8NHP8 589 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 NUP133Q8WUM0 1156 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 VEZTQ9HBM0 779 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 MYOM2P54296 1465 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 DCCP43146 1447 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 PRR36Q9H6K5 1346 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 IL15P40933 162 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 TNNI2P48788 182 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 DAAM2Q86T65 1068 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 CNKSR1Q969H4 720 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 USP6P35125 1406 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 ERICH4A6NGS2 130 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 TMCO3Q6UWJ1 677 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 NIM1KQ8IY84 436 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 CHD1LQ86WJ1 897 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 TXLNBQ8N3L3 684 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 C8orf58Q8NAV2 365 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 ARHGAP45Q92619 1136 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 GGA1Q9UJY5 639 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 KIF3CO14782 793 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 UFL1O94874 794 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 KRT32Q14532 448 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM132AQ24JP5 1023 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 IQCEQ6IPM2 695 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 IQCA1Q86XH1 822 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 UBXN4Q92575 508 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM89AQ96GI7 184 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 SNRKQ9NRH2 765 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 PDE8AO60658 829 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 TNNT1P13805 278 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 LIG1P18858 919 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 MX1P20591 662 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 ZSCAN30Q86W11 494 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 C2CD5Q86YS7 1000 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 RTL1A6NKG5 1358 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 PLCG2P16885 1265 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 RBM25P49756 843 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC96Q2M329 555 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 SMARCE1Q969G3 411 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 MRVI1Q9Y6F6 885 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 V9GYY5 206 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 TET3O43151 1660 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 TNS3Q68CZ2 1445 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A1B0GUA9 196 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 H7C1D1 291 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 TRAK2O60296 914 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 OFD1O75665 1012 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM27P14373 513 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKRD1Q15327 319 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF408Q9H9D4 720 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 ECHDC1Q9NTX5 307 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 PPIP5K2O43314 1243 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 KDM4AO75164 1064 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP2B1P20020 1258 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 MCM3P25205 808 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF76P36508 570 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 FOSBP53539 338 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 PDE4BQ07343 736 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 ODF2Q5BJF6 829 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC24Q8N4L8 307 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 MPNDQ8N594 471 aa5.11□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 BICD2Q8TD16 824 aa5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms