RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 GPSM2P81274 684 aa9.76□□□□□ -0.85
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SGMS1-201ENST00000361543 LINS1Q8NG48 757 aa9.76□□□□□ -0.85
SGMS1-201ENST00000361543 E9PSI1 815 aa9.75□□□□□ -0.85
SGMS1-201ENST00000361543 F6X3S4 739 aa9.75□□□□□ -0.85
SGMS1-201ENST00000361543 C6orf229H3BNL8 230 aa9.75□□□□□ -0.85
SGMS1-201ENST00000361543 H7C1W4 665 aa9.75□□□□□ -0.85
SGMS1-201ENST00000361543 WASHC4Q2M389 1173 aa9.75□□□□□ -0.85
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SGMS1-201ENST00000361543 SSH1Q8WYL5 1049 aa9.7□□□□□ -0.86
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SGMS1-201ENST00000361543 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
SGMS1-201ENST00000361543 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
SGMS1-201ENST00000361543 ALDH1L2Q3SY69 923 aa9.68□□□□□ -0.86
SGMS1-201ENST00000361543 EPHA10Q5JZY3 1008 aa9.68□□□□□ -0.86
SGMS1-201ENST00000361543 LMBR1LQ6UX01 489 aa9.68□□□□□ -0.86
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD2Q9GZV1 360 aa9.68□□□□□ -0.86
SGMS1-201ENST00000361543 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
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