RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	GSX2	Q9BZM3	304 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	16.61	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	OR2M5	A3KFT3	312 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	SLC16A7	O60669	478 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	IGHM	P01871	453 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	CSF2RB	P32927	897 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	PRSS3	P35030	304 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	OPCML	Q14982	345 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	POU4F3	Q15319	338 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	GRINA	Q7Z429	371 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	STK35	Q8TDR2	534 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	OMA1	Q96E52	524 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	GINS4	Q9BRT9	223 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	CA10	Q9NS85	328 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	DHDH	Q9UQ10	334 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	CDC14C	A4D256	554 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	OR2T1	O43869	369 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ITGA5	P08648	1049 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	SPARC	P09486	303 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	CRABP1	P29762	137 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	16.59	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	METTL12	A8MUP2	240 aa		16.59	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559		L7N2F9	121 aa		16.59	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	RGS11	O94810	467 aa		16.59	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	16.59	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ABCD3	P28288	659 aa		16.59	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ACTB	P60709	375 aa		16.59	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ACTG1	P63261	375 aa		16.59	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ADAM8	P78325	824 aa		16.59	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	16.59	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	GLO1	Q04760	184 aa		16.59	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	PLA2G7	Q13093	441 aa		16.59	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		16.59	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		16.59	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	COMMD7	Q86VX2	200 aa		16.59	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ASB13	Q8WXK3	278 aa		16.59	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	C8orf44	Q96CB5	159 aa		16.59	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		16.59	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	16.59	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	16.59	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	RP1	P56715	2156 aa		16.59	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		16.58	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	CIB4	A0PJX0	185 aa		16.58	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		16.58	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	SULT1C2	O00338	296 aa		16.58	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	AHSA1	O95433	338 aa		16.58	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	RRAS	P10301	218 aa		16.58	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	GTF2F2	P13984	249 aa		16.58	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	FAM166A	Q6J272	317 aa		16.58	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		16.58	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		16.58	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		16.58	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		16.58	■□□□□ 0.25
RRN3-205	ENST00000563559	PLPP3	O14495	311 aa		16.58	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	RLN1	P04808	185 aa		16.58	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	EFNB2	P52799	333 aa		16.58	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM225	Q6GV28	225 aa		16.58	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		16.58	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		16.58	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	GPR119	Q8TDV5	335 aa		16.58	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	16.58	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		16.58	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	CHRD	Q9H2X0	955 aa		16.58	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	KIF25	Q9UIL4	384 aa		16.58	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PPL8	197 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	MEGF11	A6BM72	1044 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	HMSD	A8MTL9	139 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559		H3BSH0	61 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559		I3L521	148 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	FADS1	O60427	444 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	CTLA4	P16410	223 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	FST	P19883	344 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	MAP2K6	P52564	334 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	MISP	Q8IVT2	679 aa		16.57	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		16.57	■□□□□ 0.24

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