RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557758.1

PRMT5-227, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, human

TSL 3

Gene PRMT5, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT5-227	ENST00000557758	TEAD2	Q15562	447 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	HLA-B	Q31612	363 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	EIPR1	Q53HC9	387 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	ULK3	Q6PHR2	472 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	FAM122B	Q7Z309	247 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	IFT20	Q8IY31	132 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758		Q8N1X5	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	IFT81	Q8WYA0	676 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	UFD1	Q92890	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	CCDC126	Q96EE4	140 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	OXGR1	Q96P68	337 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	REEP4	Q9H6H4	257 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	TMEM165	Q9HC07	324 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	PARVA	Q9NVD7	372 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	THYN1	Q9P016	225 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	GFY	I3L273	518 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758		K7EQD1	137 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	GMDS	O60547	372 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PPP1R3D	O95685	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	NR2C1	P13056	603 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	LEP	P41159	167 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	SLC1A1	P43005	524 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	MARCKSL1	P49006	195 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ARPP19	P56211	112 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ERVK-16	P61578	105 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	DR1	Q01658	176 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	DPT	Q07507	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	OXA1L	Q15070	435 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	UPP1	Q16831	310 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	CYP51A1	Q16850	503 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	DGUOK	Q16854	277 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	CARD16	Q5EG05	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68	2e-9	■■■□□ 16.8
PRMT5-227	ENST00000557758	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	UNC93A	Q86WB7	457 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	IQCK	Q8N0W5	287 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	KRT222	Q8N1A0	295 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	MYDGF	Q969H8	173 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	UCK2	Q9BZX2	261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	EHF	Q9NZC4	300 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	VWA8	A3KMH1	1905 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	ALPK3	Q96L96	1907 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758		A0A1W2PRD5	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758		A8MUA0	341 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	RAD51C	O43502	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	PROSC	O94903	275 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	NXPH4	O95158	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRMT5-227	ENST00000557758	CD160	O95971	181 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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