RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	DCTN6	O00399	190 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	MSTN	O14793	375 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	HEXB	P07686	556 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	CLINT1	Q14677	625 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	AGER	Q15109	404 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	AP1S3	Q96PC3	154 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	VDAC3	Q9Y277	283 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	SERTM1	A2A2V5	107 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	TP53I11	O14683	189 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	CTSL	P07711	333 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	GABRA1	P14867	456 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	PTAFR	P25105	342 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF266	Q14584	549 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	GPR137	Q96N19	417 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574		K7ESM1	405 aa		12.96	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	TXNDC12	O95881	172 aa		12.96	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	CTRB1	P17538	263 aa		12.96	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	P2RY2	P41231	377 aa		12.96	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	F2RL1	P55085	397 aa		12.96	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	METRNL	Q641Q3	311 aa		12.96	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		12.96	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	FJX1	Q86VR8	437 aa		12.96	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	C1orf198	Q9H425	327 aa		12.96	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	LDAH	Q9H6V9	325 aa		12.96	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	BET1	O15155	118 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	GPR137B	O60478	399 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	CTNS	O60931	367 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	HPX	P02790	462 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	TLE4	Q04727	773 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	EOGT	Q5NDL2	527 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	FCRL6	Q6DN72	434 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	SPTSSA	Q969W0	71 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	FBRS	Q9HAH7	460 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	RHOF	Q9HBH0	211 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	DKKL1	Q9UK85	242 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	C7orf66	A4D0T2	115 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF98	A6NK75	572 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574		H3BNC9	293 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	SUSD5	O60279	629 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	NME2P1	O60361	137 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	SCGB1D1	O95968	90 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	LCAT	P04180	440 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	CSF2RA	P15509	400 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF626	Q68DY1	528 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	LYG2	Q86SG7	212 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	KCND3	Q9UK17	655 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	RAB4B	P61018	213 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	SKA3	Q8IX90	412 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	CCL26	Q9Y258	94 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	CDK2AP1	O14519	115 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	NTSR1	P30989	418 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	SDHA	P31040	664 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	RAB38	P57729	211 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	GUCA2A	Q02747	115 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	EID2B	Q96D98	161 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	PELI1	Q96FA3	418 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574		A0A0U1RQK1	487 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	SLC35E2	P0CK97	266 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	NQO2	P16083	231 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	C21orf58	P58505	322 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
PKD1-222	ENST00000496574	ERV3-1	Q14264	604 aa		12.94	□□□□□ -0.34

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